More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2835 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  78.49 
 
 		 186 aa  312  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  75 
 
 		 188 aa  288  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  71.89 
 
 		 186 aa  286  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  70.65 
 
 		 184 aa  280  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  48.11 
 
 		 194 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  48.11 
 
 		 194 aa  175  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  47.83 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  44.62 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  43.48 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  41.85 
 
 		 178 aa  151  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  36.9 
 
 		 180 aa  141  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  39.89 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  40.43 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  35.14 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  35.98 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  37.89 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  37.95 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  34.22 
 
 		 165 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  35.26 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  36.31 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  35.68 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  35.68 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  35.11 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  38.25 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  39.79 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  33.67 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  34.09 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.9 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  33.13 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  35.75 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  33.15 
 
 		 278 aa  94.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  32.63 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  35.26 
 
 		 181 aa  94.4  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  35.26 
 
 		 181 aa  94.4  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  34.46 
 
 		 171 aa  94.4  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.97 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.3 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  31.22 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  31.22 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  34.39 
 
 		 274 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  31.79 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  34.43 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  35.16 
 
 		 167 aa  92  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  32.02 
 
 		 175 aa  91.3  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  38.01 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  30.16 
 
 		 170 aa  90.9  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  26.87 
 
 		 191 aa  90.9  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.86 
 
 		 214 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.76 
 
 		 167 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.51 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.86 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  29.79 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  31.71 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  32.45 
 
 		 173 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.18 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  32.14 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  33.92 
 
 		 169 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  30.29 
 
 		 215 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  30.29 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.65 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  31.52 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  30.29 
 
 		 215 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  30.29 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  30.29 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  30.29 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  32.94 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  30.29 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  28.95 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  30.93 
 
 		 240 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  29.81 
 
 		 215 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  31.02 
 
 		 173 aa  84.7  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  31.46 
 
 		 170 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  30.89 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  36.13 
 
 		 217 aa  84.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  32.82 
 
 		 201 aa  84.3  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  33.16 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  34.39 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  30.27 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.39 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.95 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  33.33 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  33.52 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  31.64 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  34.97 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.6 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  32.94 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  30.51 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  29.33 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  29.41 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.34 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  36.13 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.12 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  28.64 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  35.08 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  30.32 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.94 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30.22 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.88 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>