More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4783 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  100 
 
 
217 aa  438  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  67.65 
 
 
223 aa  280  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  67.16 
 
 
209 aa  274  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  54.68 
 
 
224 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  54.5 
 
 
227 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  53.17 
 
 
226 aa  208  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  58.08 
 
 
222 aa  206  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  59.09 
 
 
224 aa  205  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  52.91 
 
 
205 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  51.28 
 
 
224 aa  201  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  52 
 
 
223 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  50.24 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  55.28 
 
 
226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  49.26 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  51.31 
 
 
224 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  54.26 
 
 
230 aa  187  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  47.57 
 
 
239 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  38.01 
 
 
184 aa  121  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  38.01 
 
 
184 aa  121  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  38.46 
 
 
182 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  36.13 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  32.62 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  35.42 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.8 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.8 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  27.81 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.72 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.75 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.94 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.53 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.64 
 
 
171 aa  63.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.27 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  27.86 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  29.61 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.84 
 
 
165 aa  61.6  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.47 
 
 
167 aa  61.6  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  25.98 
 
 
184 aa  61.6  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  31.61 
 
 
176 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.59 
 
 
169 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.35 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  30.39 
 
 
239 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29 
 
 
183 aa  59.3  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1643  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.26 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.462353  normal  0.0151841 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  46.15 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  44.64 
 
 
270 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  45.61 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  26.9 
 
 
181 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.53 
 
 
166 aa  58.2  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  24.29 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.87 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  35.21 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  30.84 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  42.86 
 
 
270 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.22 
 
 
174 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  31.58 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  27.53 
 
 
166 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  27.23 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  29.65 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.61 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  29.65 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.96 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  45.31 
 
 
368 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  29.65 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  54.35 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  29.65 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  54.35 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  54.35 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  29.65 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  50 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  54.35 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.42 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.66 
 
 
176 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  50.85 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.93 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.84 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  29.15 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  29.15 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  30.21 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.96 
 
 
252 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  43.14 
 
 
182 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  28.21 
 
 
181 aa  55.1  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  28.21 
 
 
181 aa  55.1  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3679  nitroreductase  29.94 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  23.04 
 
 
173 aa  55.1  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  42.47 
 
 
221 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  34.24 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  40 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  31.9 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  23.59 
 
 
178 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.16 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  41.82 
 
 
177 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  26.92 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.26 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  26.11 
 
 
170 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.11 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  34.24 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  42.65 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  23.98 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  31.82 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  33.14 
 
 
185 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>