299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2239 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  100 
 
 		 239 aa  490  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  70 
 
 		 223 aa  318  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  50.98 
 
 		 209 aa  194  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  45.62 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  50.24 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  52.26 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  45.45 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  45.24 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  44.09 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  45.87 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  47.57 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  46.12 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  44.29 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  46.08 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  49.11 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  48.47 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  50.78 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  32.76 
 
 		 184 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  32.76 
 
 		 184 aa  90.5  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  30.86 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.25 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.96 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.21 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.17 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.53 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.89 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.87 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.07 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.61 
 
 		 171 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  43.33 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  26.21 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.81 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.33 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  28.57 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.9 
 
 		 584 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.05 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.18 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.37 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  25.26 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  25.26 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.32 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  43.37 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  33 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  30.67 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.38 
 
 		 448 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.36 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  41.51 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.39 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.4 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.43 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.15 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42.47 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  27.37 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  32.37 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  39.39 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  40.91 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  46.3 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  31.62 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  26.97 
 
 		 350 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  31.43 
 
 		 348 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  24.86 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.06 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.75 
 
 		 170 aa  52  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  45.33 
 
 		 471 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_003296  RS03753  oxidoreductase protein  29.5 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1054  nitroreductase family protein  25.37 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.49 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.49 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.86 
 
 		 176 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  44 
 
 		 455 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0993  nitroreductase family protein  25.37 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  27.18 
 
 		 345 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  23.4 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  25.43 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.91 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  44 
 
 		 455 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.91 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  28.5 
 
 		 458 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  38.98 
 
 		 165 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  46.03 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  37.97 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  46.55 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.86 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  43.48 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  54.17 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  43.48 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  32.94 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.27 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1710  nitroreductase family protein  43.33 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.86 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  36 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  23.86 
 
 		 175 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 		 982 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  50.98 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  40 
 
 		 166 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.67 
 
 		 174 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  38.89 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  40.74 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  27.15 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.25 
 
 		 446 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>