168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00908 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  100 
 
 		 224 aa  472  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  72.68 
 
 		 205 aa  322  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  69.09 
 
 		 223 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  67.73 
 
 		 227 aa  310  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  68.18 
 
 		 223 aa  309  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  67.27 
 
 		 224 aa  304  6e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  65.91 
 
 		 224 aa  298  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  65 
 
 		 226 aa  298  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  58.99 
 
 		 222 aa  259  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  56.22 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  54.02 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  57.81 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  54.68 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  50 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  51.47 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  48.29 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  45.62 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  31.35 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  31.35 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  31.47 
 
 		 182 aa  97.8  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.55 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.15 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.61 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.57 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  23.12 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  25.5 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.47 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  32.84 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.23 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.2 
 
 		 171 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  23.23 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  37.1 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  25.55 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  37.5 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  26.94 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  27.84 
 
 		 167 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.73 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  31 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.4 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.91 
 
 		 179 aa  52.4  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.82 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  25.7 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  41.94 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.38 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  25.13 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  46.94 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  38.18 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  24.76 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  24.74 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.28 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.41 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  34.92 
 
 		 345 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.62 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  32.84 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.62 
 
 		 170 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  25.49 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  23.15 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  23 
 
 		 167 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  33.93 
 
 		 270 aa  48.5  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  41.54 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  42.19 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  37.5 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  21.84 
 
 		 168 aa  48.5  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  37.93 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  33.93 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  25.63 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  25.63 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.63 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  25.53 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  33.87 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  37.93 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1328  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.44 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  36.67 
 
 		 169 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  33.33 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  40.98 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  36.36 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  24.22 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  40 
 
 		 174 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.63 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  37.93 
 
 		 166 aa  46.2  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  24.14 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  41.38 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  39.29 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  22.34 
 
 		 163 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2527  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.7 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  35.38 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  33.33 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  21.47 
 
 		 173 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  32.53 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  37.5 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  29.41 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  23.81 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  28.57 
 
 		 166 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.96 
 
 		 221 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  30.43 
 
 		 239 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.66 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  33.85 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  34.92 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  24.75 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.6 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>