278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2200 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  54.02 
 
 		 224 aa  258  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  58.91 
 
 		 224 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  57.07 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  58.91 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  64.65 
 
 		 222 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  54.05 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  52.97 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  55.39 
 
 		 205 aa  241  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  57.36 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  56.7 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  59.02 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  55.83 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  57.87 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  59.2 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  48.79 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  50.22 
 
 		 239 aa  191  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  39.01 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  32 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  32 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.68 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.53 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.74 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.59 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  29.33 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.71 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  41.54 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.1 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  31.61 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.65 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  33.64 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  30.65 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  50 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  31.03 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  28.27 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.43 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  37.14 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  24.57 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  41.27 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  41.89 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  25.55 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.55 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  28.63 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  24.78 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.93 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  24.23 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  41.51 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  49.06 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  40.62 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  39.66 
 
 		 270 aa  52  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  25.26 
 
 		 171 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  42.59 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  51.02 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  26.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  38.18 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  23.74 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  27.5 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  53.33 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  24.62 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.25 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  27.39 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  42.86 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.01 
 
 		 175 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  47.83 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  24.43 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  48.89 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  48.89 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.65 
 
 		 167 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  37.74 
 
 		 166 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  43.1 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  45.31 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  22.37 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  25.84 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  38.18 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.92 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  27.32 
 
 		 363 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.46 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.48 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  38.24 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42.67 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  26.32 
 
 		 166 aa  48.9  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  37.5 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  45 
 
 		 171 aa  48.9  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  36.05 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.55 
 
 		 174 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  47.27 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.16 
 
 		 170 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  28.57 
 
 		 295 aa  48.5  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  34.55 
 
 		 180 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  24.73 
 
 		 166 aa  48.5  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  23.53 
 
 		 180 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  46.67 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  46.67 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  23.61 
 
 		 185 aa  48.5  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.28 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  26.42 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  26 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  35.29 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  41.43 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>