280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7105 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  93.01 
 
 
229 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  69.3 
 
 
235 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  68.89 
 
 
235 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  67.56 
 
 
235 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  66.96 
 
 
231 aa  323  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  67.84 
 
 
242 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  67.86 
 
 
242 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  67.86 
 
 
242 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  67.86 
 
 
242 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  67.41 
 
 
239 aa  309  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  64.55 
 
 
249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  63.06 
 
 
254 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  63.06 
 
 
254 aa  294  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  62.88 
 
 
258 aa  293  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  61.36 
 
 
242 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  63.64 
 
 
247 aa  290  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  60.91 
 
 
224 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  61.3 
 
 
257 aa  285  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  63.06 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  60.89 
 
 
236 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  57.27 
 
 
237 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  56.89 
 
 
239 aa  251  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  55.41 
 
 
231 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  51.97 
 
 
228 aa  244  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  54.84 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  53.36 
 
 
228 aa  237  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  50.91 
 
 
233 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  52.91 
 
 
224 aa  231  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  53.74 
 
 
245 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  50 
 
 
224 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  47.3 
 
 
223 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  46.88 
 
 
233 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  45.29 
 
 
221 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  46.64 
 
 
223 aa  201  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  47.96 
 
 
223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  44.49 
 
 
229 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  42.79 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  42.6 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  39.91 
 
 
223 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  40.91 
 
 
226 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  44.2 
 
 
223 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  40.91 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  38.91 
 
 
226 aa  154  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  39.01 
 
 
221 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  42.67 
 
 
232 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  39.19 
 
 
221 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  36.4 
 
 
230 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  40.36 
 
 
228 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  44.24 
 
 
232 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  38.43 
 
 
221 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  39.29 
 
 
222 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  39.53 
 
 
238 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  39.29 
 
 
222 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  39.35 
 
 
235 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  40.65 
 
 
219 aa  148  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  38.91 
 
 
220 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  38.84 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  40.93 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  42.53 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  35.53 
 
 
232 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  37.83 
 
 
241 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  33.77 
 
 
232 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  34.21 
 
 
231 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  34.86 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  34.53 
 
 
244 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  32.16 
 
 
220 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  34.08 
 
 
241 aa  131  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  31.53 
 
 
225 aa  125  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  37.38 
 
 
225 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  31.67 
 
 
231 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  32.57 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  32.33 
 
 
228 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  30.49 
 
 
224 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  31.58 
 
 
230 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  33.18 
 
 
237 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  30.53 
 
 
225 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  32.16 
 
 
225 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  31.42 
 
 
234 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28.38 
 
 
221 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  30.17 
 
 
270 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  29.69 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  30.45 
 
 
235 aa  98.2  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  30.45 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  29.15 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  28.32 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  28.83 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  30.8 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  23.89 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.78 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  27.14 
 
 
345 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  27.51 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27.51 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  27.51 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.19 
 
 
334 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27.07 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  27.39 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.07 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.07 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.57 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>