More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5013 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  99.55 
 
 		 222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  73.76 
 
 		 221 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  74.43 
 
 		 221 aa  347  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  74.43 
 
 		 221 aa  345  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  50.67 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  47.51 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  43.18 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  47.3 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  45.45 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  41.74 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  35.59 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  41.98 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  39.09 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  40.18 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  39.29 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  37.61 
 
 		 236 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  38.24 
 
 		 231 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  39.27 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  37.67 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  38.29 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  33.94 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  35.75 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  38.81 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  37.04 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  38.25 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  37.5 
 
 		 220 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  40.62 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  38.46 
 
 		 236 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  35.38 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  36.11 
 
 		 219 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  35.53 
 
 		 231 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  38.57 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  36.87 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  33.33 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  40.27 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  34.4 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  34.91 
 
 		 233 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  39.73 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  34.86 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  35.43 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  35.91 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  36.04 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  36.09 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  35.11 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  39.29 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  39.29 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  36.04 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  33.04 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  35.02 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  34.72 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  37.5 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  37.69 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  34.88 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  34.53 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  38 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  34.35 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  32.72 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  31.22 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  33.18 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  34.1 
 
 		 237 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  32.88 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  32.89 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  31.63 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  32.29 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  40.3 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  35.29 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  35.29 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  32.71 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  32.3 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  36.94 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  29.02 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  36.96 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  36.23 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  30.8 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  37.68 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  30.59 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  29.55 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  30.32 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  29.91 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  26.46 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  29.13 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  29.68 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.67 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  27.05 
 
 		 270 aa  72  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  24.89 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  24.65 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  37.74 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  50.94 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  49.21 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  45.45 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  51.02 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  49.02 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  40.91 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  50.98 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.51 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  52 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  46.58 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  52 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>