262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3982 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  100 
 
 
233 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  49.55 
 
 
242 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  49.09 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  44.87 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  49.09 
 
 
239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  46.88 
 
 
229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  49.32 
 
 
224 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  45.33 
 
 
231 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  49.07 
 
 
242 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  47.49 
 
 
242 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  47.49 
 
 
224 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  47.2 
 
 
236 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  48.6 
 
 
242 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  48.6 
 
 
242 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  45.05 
 
 
235 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  46.88 
 
 
229 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  48.17 
 
 
246 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  45 
 
 
228 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  48.17 
 
 
233 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  46.82 
 
 
235 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  45.66 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  47.47 
 
 
247 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  45.62 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  45.66 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  44.5 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  45.21 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  47.14 
 
 
228 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  45.45 
 
 
224 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  42.99 
 
 
223 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  45.73 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  43.64 
 
 
223 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  42.06 
 
 
226 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  40.79 
 
 
257 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  41.15 
 
 
258 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  43.69 
 
 
225 aa  175  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  41.01 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  40.09 
 
 
236 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  39.11 
 
 
231 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  40.57 
 
 
240 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  43.64 
 
 
223 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  40.45 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  38.36 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  41.94 
 
 
219 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  41.47 
 
 
219 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  38.25 
 
 
229 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  39.45 
 
 
221 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  41.12 
 
 
221 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  40.91 
 
 
226 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  40.7 
 
 
221 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  39.09 
 
 
222 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  39.09 
 
 
222 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  38.58 
 
 
222 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  39.04 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  38.53 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  37.22 
 
 
235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  41.15 
 
 
225 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  36.36 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  39.35 
 
 
224 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  39.72 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  33.78 
 
 
225 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  39.81 
 
 
232 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  39.81 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  38.36 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  35.59 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  35.78 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  35.19 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  34.84 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  33.64 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  34.7 
 
 
232 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  35.19 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  34.26 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  36.36 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  35.56 
 
 
225 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  31.6 
 
 
215 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  32.3 
 
 
238 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  33.18 
 
 
241 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  34.1 
 
 
229 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  34.56 
 
 
225 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  33.33 
 
 
231 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  33.48 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  32.26 
 
 
231 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  31.67 
 
 
223 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  30.09 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  28.1 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  29.17 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  26.79 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  25.54 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.8 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  38.95 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.45 
 
 
187 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.01 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  27.14 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  44.23 
 
 
165 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25.33 
 
 
252 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  26.11 
 
 
176 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.59 
 
 
190 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  46.15 
 
 
180 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  23.28 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  26.37 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>