273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00135 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  100 
 
 		 227 aa  478  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  75.23 
 
 		 224 aa  367  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  74.34 
 
 		 226 aa  363  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  74.89 
 
 		 223 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  72.07 
 
 		 223 aa  344  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  72 
 
 		 224 aa  338  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  67.73 
 
 		 224 aa  310  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  67.96 
 
 		 205 aa  299  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  59.46 
 
 		 222 aa  259  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  58.3 
 
 		 226 aa  251  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  57.36 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  55.33 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  54.5 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  49.54 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  50.96 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  47.51 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  45.87 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  36.57 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  36.57 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  34.52 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  34.65 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  25.98 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  30.77 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.67 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.14 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  55.32 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.82 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.13 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  31.37 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.07 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  48.15 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.92 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  50 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  27.09 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  36.84 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  24.86 
 
 		 167 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  47.37 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  37.08 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  24.73 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  38.24 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.37 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.27 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.67 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.77 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  36.78 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  41.67 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  41.67 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  36.36 
 
 		 265 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  39.13 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  33.33 
 
 		 166 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  46.15 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  46.15 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  47.17 
 
 		 166 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  46.15 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  39.66 
 
 		 175 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  39.34 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  25 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  50 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  50 
 
 		 174 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  28.47 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  28.89 
 
 		 345 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  42.59 
 
 		 166 aa  52.4  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  37.1 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  47.17 
 
 		 166 aa  52.4  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  26.9 
 
 		 175 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  36 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  23.32 
 
 		 178 aa  52  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.25 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  42.55 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  42.59 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  25.93 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  28.43 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  28.43 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  42.62 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  37.93 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  50 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  22.22 
 
 		 169 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  41.18 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  40.82 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.13 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  25.62 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.72 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  24.4 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.22 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  38 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  27.57 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.67 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.48 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  23.08 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  22.6 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.37 
 
 		 170 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  28.21 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.87 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  34.48 
 
 		 166 aa  49.3  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.72 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  31.67 
 
 		 171 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  28.06 
 
 		 171 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>