220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2969 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  56 
 
 		 226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  52.47 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  47.98 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  47.27 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  45.74 
 
 		 223 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  50.45 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  44.04 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  45.74 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  45.29 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  40.99 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  42.66 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  39.53 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  45.09 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  41.74 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  41.74 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  39.72 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  43.06 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  41.28 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  40.18 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  34.76 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  38.03 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  39.35 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  39.35 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  38.29 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  37.22 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  34.8 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  37.44 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  36.45 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  36.89 
 
 		 257 aa  141  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  35.09 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  37.05 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  37.5 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  36.57 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  33.03 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  37.85 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  38.68 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  35.35 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  35.87 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  40.09 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  36.49 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  39.91 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  35.68 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  38.53 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  38.05 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  32.3 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  38.25 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  38.25 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  38.25 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  36.44 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  35.29 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  34.84 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  34.43 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  34.43 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  31.31 
 
 		 226 aa  121  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  35.85 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  33.82 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  35.94 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  31.94 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  32.61 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  28.83 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  30.18 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  30.97 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  29.39 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  32.06 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  29.73 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  32.85 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  36.32 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  29.28 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  31.72 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  36.32 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  29.91 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  28 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  29.78 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  29.33 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  31.02 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  26.75 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  29.36 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  29.02 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  30.74 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.67 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  30.23 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  28.63 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  27.31 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  26.82 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  27.96 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  27.04 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  26.36 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  29.21 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0829  nitroreductase  26.85 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12062  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0846  nitroreductase  26.85 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0164733  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  32.84 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  36.78 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  39.19 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  43.14 
 
 		 169 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  20.91 
 
 		 168 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  41.18 
 
 		 165 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  38.46 
 
 		 186 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  38.46 
 
 		 186 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  38.46 
 
 		 186 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>