More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5314 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  99.56 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  99.56 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  100 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  83.7 
 
 
241 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  82.67 
 
 
225 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  50.97 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  36.28 
 
 
280 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  33.17 
 
 
223 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  31.28 
 
 
234 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  32.13 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  30.37 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.59 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.85 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  31.63 
 
 
546 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  30.29 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  32.06 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.05 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.41 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.8 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.5 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  29.67 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25 
 
 
176 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.64 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.64 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  30.05 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  30 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.23 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.77 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.16 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.7 
 
 
584 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  27.8 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  27.68 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.94 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  26.9 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.43 
 
 
186 aa  72  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.49 
 
 
221 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.72 
 
 
167 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  30 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.63 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.94 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.04 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.73 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.57 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.48 
 
 
814 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.86 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.44 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  27.72 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  29.52 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  29.52 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.72 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  29.05 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.12 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.12 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  30.56 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.84 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1022  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.57 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  0.22083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  30.66 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.98 
 
 
269 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.64 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3155  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.9 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.36 
 
 
173 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  49.21 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.24 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  28.37 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.47 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.93 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.23 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.34 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  29.13 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.49 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  26.42 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  28.31 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.77 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.94 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.76 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.51 
 
 
214 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.17 
 
 
279 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.05 
 
 
219 aa  62.4  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3749  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.99 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.219924  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.77 
 
 
324 aa  62  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1863  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.75 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000280674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.8 
 
 
192 aa  62  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.48 
 
 
221 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.37 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  26.61 
 
 
230 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  49.12 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.34 
 
 
177 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2608  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.72 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.469084  normal  0.0132416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  22.45 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  45.76 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29 
 
 
169 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  27.4 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.14 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.14 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  23.58 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3679  nitroreductase  25.89 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  25.85 
 
 
170 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  28.08 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>