288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2909 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  33.33 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  32.21 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  30.99 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  30.28 
 
 		 280 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  30.41 
 
 		 241 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  30.37 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  30.37 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  30.37 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  30.37 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.93 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.84 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.36 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.32 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  30.6 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  31.61 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  31.03 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.81 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.95 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  26.05 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.8 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.62 
 
 		 584 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  30.41 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  26.11 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  29 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.56 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  28.04 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 982 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  23.5 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.06 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  25.58 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.32 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  31.05 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  31.25 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.79 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  25.79 
 
 		 166 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  28.22 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.9 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.8 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  28.5 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.92 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.15 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.12 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  26.04 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  23.23 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  23.74 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  27.66 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  28.23 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  41.25 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.5 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  22.8 
 
 		 170 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.03 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  28.99 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  29.13 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.11 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  27.14 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  29.13 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  27.66 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.13 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  27.66 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  28.3 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.5 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.16 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  27.13 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.51 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1683  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.99 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000634411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  25.46 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  23.15 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  25.96 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.84 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  27.23 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  29.13 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3679  nitroreductase  29.11 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  29.13 
 
 		 411 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  30.71 
 
 		 350 aa  58.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.73 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  29.13 
 
 		 394 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.24 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.41 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  24.24 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  23.23 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  27.66 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.41 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.64 
 
 		 814 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  26.56 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  28.64 
 
 		 368 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  28.43 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  26.73 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  25.71 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  27.46 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.21 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3155  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.14 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.7 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  24.75 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.87 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.32 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  25.25 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>