More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5732 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  100 
 
 
235 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  61.75 
 
 
231 aa  281  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  60.66 
 
 
221 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  58.77 
 
 
228 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  59.35 
 
 
230 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  58.88 
 
 
230 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  58.41 
 
 
230 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2042  nitroreductase  57.78 
 
 
228 aa  261  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  55.66 
 
 
324 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1683  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  56.54 
 
 
235 aa  256  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000634411  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  56.67 
 
 
216 aa  255  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3177  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  56.54 
 
 
253 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  57.08 
 
 
217 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  55.19 
 
 
214 aa  251  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  57.14 
 
 
269 aa  251  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1013  nitroreductase family protein  56.25 
 
 
214 aa  250  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  55.61 
 
 
253 aa  248  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  54.81 
 
 
214 aa  248  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1863  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  55.02 
 
 
220 aa  244  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000280674 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  54.59 
 
 
222 aa  244  8e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  52.75 
 
 
219 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2810  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  54.46 
 
 
226 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  51.66 
 
 
216 aa  237  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  54.15 
 
 
218 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  47.42 
 
 
236 aa  224  6e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  47.2 
 
 
814 aa  208  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2320  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
1580 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  46.34 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  44.39 
 
 
227 aa  191  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  47.52 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  44.86 
 
 
275 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.63 
 
 
228 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  44.81 
 
 
394 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  44.81 
 
 
411 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42.86 
 
 
219 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  44.81 
 
 
351 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2803  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.78 
 
 
235 aa  177  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.662243 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  44.81 
 
 
219 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  44.81 
 
 
219 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  40.65 
 
 
982 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  44.81 
 
 
219 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  44.81 
 
 
368 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.46 
 
 
247 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0704  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.87 
 
 
249 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.46 
 
 
247 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.4 
 
 
249 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.46 
 
 
247 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4461  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.35 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.219812  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1657  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42.72 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.35 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0381  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  44.66 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.46 
 
 
248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42.16 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  45.63 
 
 
212 aa  171  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.78 
 
 
584 aa  168  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42.03 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.14 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2763  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40.83 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0692468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43 
 
 
213 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.71 
 
 
231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2554  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42.51 
 
 
225 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.46 
 
 
217 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2149  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.04 
 
 
230 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0566543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2617  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.55 
 
 
237 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  45.45 
 
 
221 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42.79 
 
 
218 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42.06 
 
 
240 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  44.24 
 
 
216 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1643  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40.85 
 
 
216 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.462353  normal  0.0151841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47750  hypothetical protein  40 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327948  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4116  hypothetical protein  40 
 
 
218 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1233  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40.85 
 
 
216 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1544  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40 
 
 
253 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233491  normal  0.110997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0684  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.89 
 
 
214 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0271  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.88 
 
 
233 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.04 
 
 
233 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3679  nitroreductase  37.91 
 
 
216 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1674  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40.83 
 
 
216 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505053  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.61 
 
 
213 aa  148  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40.83 
 
 
216 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1710  nitroreductase family protein  37.91 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2717  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.2 
 
 
215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3155  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.34 
 
 
217 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1022  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  45.86 
 
 
212 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  0.22083 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0487  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.44 
 
 
481 aa  141  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0279715  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0452  uroporphyrinogen-III methylase  39.44 
 
 
481 aa  141  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.8 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4520  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.55 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3749  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.38 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.219924  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2213  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  38.5 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0138908  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  36.71 
 
 
223 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.39 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03753  oxidoreductase protein  42.38 
 
 
216 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451042  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2608  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  38.69 
 
 
217 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.469084  normal  0.0132416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.39 
 
 
221 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1273  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.28 
 
 
216 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192281  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10311  oxidoreductase  43.13 
 
 
223 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.655212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1350  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.11 
 
 
216 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4721  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.98 
 
 
227 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0276935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4807  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.98 
 
 
214 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.394425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>