97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  100 
 
 		 241 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  45.02 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  45.02 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  44.59 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  41.99 
 
 		 213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  42.24 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  43.35 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  38.37 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  40 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  43.98 
 
 		 206 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  42.67 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  37.5 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  39.21 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  30.28 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  27.88 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  27.12 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  30.3 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  29.24 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  28.21 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.02 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  27.04 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.54 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  27 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 		 546 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.46 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  26.72 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  25.67 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  25.71 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.35 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.8 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  42.25 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  27.19 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  24.78 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  24.78 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  26.79 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  24.78 
 
 		 166 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  32.94 
 
 		 334 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  40.35 
 
 		 165 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.77 
 
 		 170 aa  48.9  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  36.84 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  33.86 
 
 		 350 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  45.61 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  34.62 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.22 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  43.33 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  36.36 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  43.1 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  22.61 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  41.67 
 
 		 174 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  34.26 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  50 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  36.84 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  40.74 
 
 		 166 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  44.12 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  48.08 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  33.33 
 
 		 169 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  23.14 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  33.85 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  37.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  37.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  37.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  37.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  37.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  34.78 
 
 		 345 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  35.94 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  39.13 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  28.82 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  45.9 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  36.71 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  35.9 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  35.9 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  21.88 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  28.19 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  36.36 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  32.86 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  23.98 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  26.54 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  30 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  47.37 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  24.23 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  30.91 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.48 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  39.06 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  42.59 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  35.38 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  34.72 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  44.44 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  28.05 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25.36 
 
 		 190 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  34.48 
 
 		 170 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  37.29 
 
 		 173 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  42.65 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  51.16 
 
 		 174 aa  42  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  42.86 
 
 		 192 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  25.51 
 
 		 181 aa  42  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  30.1 
 
 		 274 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.29 
 
 		 217 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>