95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0797 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  100 
 
 
230 aa  481  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  48.02 
 
 
546 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  40.09 
 
 
218 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  37.5 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  35.5 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  34.98 
 
 
225 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  32.74 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  29.44 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  28.07 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  26.52 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  28.07 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  26.11 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  27.43 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  27.04 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  29.38 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  27.87 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  28.37 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  28.37 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.5 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  28.37 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  25.33 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  27.56 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  26.37 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  28.85 
 
 
213 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.89 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.47 
 
 
213 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  23.65 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  27.54 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  37.5 
 
 
166 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.5 
 
 
186 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.09 
 
 
204 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  26.92 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  22.12 
 
 
166 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  23.39 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  22.12 
 
 
166 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.33 
 
 
176 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  25.24 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  22.89 
 
 
190 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  22.17 
 
 
334 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  26.07 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  26.07 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  26.07 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26 
 
 
188 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.58 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  23.65 
 
 
287 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.74 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.79 
 
 
165 aa  48.5  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  22.43 
 
 
170 aa  48.5  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  22.11 
 
 
348 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.88 
 
 
184 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  40.35 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  25.62 
 
 
189 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  22.22 
 
 
450 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  33.87 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  23.23 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  45.45 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.58 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.31 
 
 
179 aa  46.2  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  35.59 
 
 
199 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  23.08 
 
 
272 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  27.78 
 
 
274 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  22.12 
 
 
183 aa  46.2  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  24.89 
 
 
172 aa  45.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  23.77 
 
 
190 aa  45.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  21.63 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  41.82 
 
 
223 aa  45.1  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.27 
 
 
177 aa  45.1  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  35.29 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  22.45 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  32.2 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  23.33 
 
 
241 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.51 
 
 
168 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  37.1 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  25.99 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  20.69 
 
 
350 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.7 
 
 
324 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  19.73 
 
 
180 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  24.52 
 
 
169 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  21.3 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  28.21 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  29.69 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  31.82 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  24.55 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  45.65 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  22.59 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.14 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  33.33 
 
 
166 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.14 
 
 
174 aa  42.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  37.93 
 
 
245 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  34.38 
 
 
246 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  21.95 
 
 
186 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  38.98 
 
 
240 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  33.33 
 
 
170 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  36.67 
 
 
167 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>