139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1045 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  407  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  86.67 
 
 		 195 aa  359  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  68.72 
 
 		 195 aa  298  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  68.21 
 
 		 195 aa  294  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  67.69 
 
 		 195 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  62.5 
 
 		 196 aa  263  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  61.46 
 
 		 194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  59.79 
 
 		 195 aa  239  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  61.03 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  59.69 
 
 		 202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  58.64 
 
 		 194 aa  231  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  58.64 
 
 		 194 aa  231  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  58.64 
 
 		 194 aa  231  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  58.64 
 
 		 194 aa  231  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  58.64 
 
 		 194 aa  231  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  58.64 
 
 		 194 aa  231  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  58.64 
 
 		 194 aa  231  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  224  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  54.01 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  54.87 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  53.81 
 
 		 210 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  55.5 
 
 		 196 aa  214  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  50.52 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  50.52 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  51.56 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  50.52 
 
 		 196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  50.52 
 
 		 196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  50.52 
 
 		 196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  50.52 
 
 		 196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  211  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  55.08 
 
 		 197 aa  210  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  56.25 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  51.04 
 
 		 194 aa  207  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  49.48 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  52.04 
 
 		 195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  49.74 
 
 		 196 aa  195  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  51.81 
 
 		 197 aa  194  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  49.74 
 
 		 197 aa  190  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  55.56 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  45.26 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  44.79 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  45.92 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  41.62 
 
 		 203 aa  154  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  43.78 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  41.97 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  49.08 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  40.22 
 
 		 258 aa  148  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  40.31 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  41.08 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  41.67 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  36.18 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  37 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  38.04 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  33.5 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  37.82 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  31.75 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  28.11 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  24.86 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  25.4 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  24.73 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  25.97 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  25.27 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  26.32 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  27.98 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.43 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  26.42 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  30.25 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  29.88 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  29.88 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  25.41 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  25.28 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  25.28 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  27.45 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  23.6 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  27.96 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  23.65 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  23.66 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  23.65 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  23.65 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  30.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  30.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  30.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  25.67 
 
 		 329 aa  45.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  29.33 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  23.6 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  24.72 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  30.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  24.32 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2527  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.8 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  24.32 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  28.87 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  25.24 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  23.03 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.95 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  23.03 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  21.71 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  25 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  35 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>