148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2634 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  97.45 
 
 		 196 aa  396  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  97.45 
 
 		 196 aa  396  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  96.94 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  97.45 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  96.94 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  96.94 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  97.45 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  85.2 
 
 		 196 aa  355  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  63.96 
 
 		 197 aa  271  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  61.46 
 
 		 194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  60.94 
 
 		 194 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  58.46 
 
 		 218 aa  248  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  60.43 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  60.43 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  60.43 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  60.43 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  60.43 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  60.43 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  60.43 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  65.93 
 
 		 199 aa  244  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  59.79 
 
 		 194 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  58.55 
 
 		 196 aa  242  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  57.14 
 
 		 196 aa  240  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  57.67 
 
 		 196 aa  237  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  58.29 
 
 		 202 aa  236  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  55.96 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  58.82 
 
 		 195 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  54.59 
 
 		 210 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  53.12 
 
 		 195 aa  222  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  52.6 
 
 		 195 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  52.08 
 
 		 195 aa  218  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  56.54 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  54.55 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  50.52 
 
 		 195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  211  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  50.25 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  54.45 
 
 		 197 aa  204  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  52.13 
 
 		 194 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  51.02 
 
 		 201 aa  197  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  51.55 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  53.16 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  46.19 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  43.46 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  42.41 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  41.24 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  42.55 
 
 		 258 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  47.53 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  42.02 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  40 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  37.89 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  37.02 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  32.46 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  38.04 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  33.17 
 
 		 221 aa  107  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  34.74 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  27.13 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  26.44 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  30.67 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  27.22 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  27.22 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  27.22 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  27.22 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  26.01 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  27.22 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  31.14 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  26.04 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  29.73 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  28.26 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  29.45 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  29.27 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  27.95 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  22.91 
 
 		 329 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  27.95 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  25.45 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.48 
 
 		 330 aa  52.4  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  27.43 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  29.49 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  26.34 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  25.82 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  24.38 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  25.82 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  26.04 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  25.82 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  27.61 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  26.04 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  24.51 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  24.54 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  24.51 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  23.78 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  24.02 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  24.02 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  25.27 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.46 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.63 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  25.33 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  25.27 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  25.27 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  24.02 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  25.27 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>