219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0299 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  56.35 
 
 
197 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  58.76 
 
 
195 aa  231  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  58.55 
 
 
194 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  60 
 
 
195 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  55.33 
 
 
196 aa  227  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  58.67 
 
 
196 aa  225  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  52.66 
 
 
210 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  56.25 
 
 
194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  56.25 
 
 
194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  56.25 
 
 
194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  56.25 
 
 
194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  56.25 
 
 
194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  56.25 
 
 
194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  56.25 
 
 
194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  55.96 
 
 
194 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  55.73 
 
 
202 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  53.81 
 
 
196 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  51.27 
 
 
196 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  52.38 
 
 
196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  50.76 
 
 
196 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  50.76 
 
 
196 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  55.1 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  50.76 
 
 
196 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  50.25 
 
 
196 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  50.25 
 
 
196 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  52.28 
 
 
196 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  50.76 
 
 
196 aa  210  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  50.25 
 
 
196 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  52.85 
 
 
195 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  52.33 
 
 
195 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  52.33 
 
 
195 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  50.26 
 
 
194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  49.74 
 
 
195 aa  195  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  46.7 
 
 
197 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  47.67 
 
 
218 aa  191  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  48.19 
 
 
195 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  57.92 
 
 
199 aa  187  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  51.6 
 
 
197 aa  187  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  48.98 
 
 
197 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  49.74 
 
 
196 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  48.76 
 
 
201 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  46.63 
 
 
194 aa  170  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  46.07 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  43.72 
 
 
195 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  45.5 
 
 
201 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  43.52 
 
 
208 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  49.09 
 
 
188 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  43.46 
 
 
201 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  40.96 
 
 
203 aa  141  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  41.71 
 
 
206 aa  141  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  36.73 
 
 
208 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  38.27 
 
 
221 aa  125  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  38.46 
 
 
213 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  35.87 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  36.27 
 
 
201 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  31.67 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  30.32 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  33.33 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  30.43 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  28.78 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  31.58 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  30.17 
 
 
204 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  26.7 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  25.57 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  28.06 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  25.57 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  25.57 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  25.57 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  30.73 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  35.21 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  26.14 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  31.54 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  26.67 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  28.37 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  26.95 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  23.53 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  31.33 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  29.31 
 
 
213 aa  55.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  29.03 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  26.67 
 
 
200 aa  55.1  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
330 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  28.85 
 
 
315 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  29.14 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  26.98 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  27.61 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  30 
 
 
201 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  26.59 
 
 
212 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  28.66 
 
 
217 aa  52  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  29.33 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  30.59 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  30.56 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  30.56 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  30.56 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  30.56 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  30.56 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  28.67 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  27.78 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  29.44 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3233  nitroreductase  23.62 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>