182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0870 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  98.46 
 
 		 195 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  88.21 
 
 		 195 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  67.69 
 
 		 195 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  67.69 
 
 		 195 aa  291  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  60.1 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  60.31 
 
 		 195 aa  247  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  61.78 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  61.78 
 
 		 202 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  61.26 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  61.26 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  61.26 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  61.26 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  61.26 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  61.26 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  61.26 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  60.43 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  58.55 
 
 		 194 aa  237  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  54.69 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  58.03 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  54.29 
 
 		 210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  55.21 
 
 		 194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  53.65 
 
 		 196 aa  226  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  58.12 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  54.92 
 
 		 197 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  52.6 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  52.6 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  52.08 
 
 		 196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  52.6 
 
 		 196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  52.6 
 
 		 196 aa  221  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  53.33 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  56.12 
 
 		 195 aa  214  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  51.85 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  54.55 
 
 		 197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  52.85 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  52.33 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  49.22 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  47.67 
 
 		 197 aa  187  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  48.99 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  45.6 
 
 		 208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  44.39 
 
 		 201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  43.75 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  41.67 
 
 		 258 aa  158  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  42.49 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  47.85 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  43.75 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  38.66 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  38.22 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  36.92 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  37.24 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  35.71 
 
 		 221 aa  125  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  33.7 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  35.05 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  30.05 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.22 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  30.53 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  28.5 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  24.71 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  28.33 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.61 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  24.14 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  30.25 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  30.77 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  29.07 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.44 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  29.07 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  28.49 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  28.75 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  27.78 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  27.78 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  28.02 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  28.57 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  30.36 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  24.58 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  26.14 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  26.06 
 
 		 246 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  37.08 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  27.63 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  29.01 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  30.2 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  27.87 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  22.65 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  29.33 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  24.29 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  24.29 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  24.29 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  24.29 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  28.4 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>