143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03909 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  80.51 
 
 
196 aa  317  9e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  73.58 
 
 
194 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  73.58 
 
 
194 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  73.58 
 
 
194 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  73.58 
 
 
194 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  73.58 
 
 
194 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  73.58 
 
 
194 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  73.58 
 
 
194 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  72.02 
 
 
202 aa  272  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  70.98 
 
 
195 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  65.97 
 
 
194 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  65.97 
 
 
194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  60.1 
 
 
196 aa  246  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  60.1 
 
 
196 aa  246  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  60.1 
 
 
196 aa  247  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  60.1 
 
 
196 aa  246  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  59.59 
 
 
196 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  60.71 
 
 
197 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  59.59 
 
 
196 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  59.07 
 
 
196 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  58.55 
 
 
196 aa  242  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  58.03 
 
 
196 aa  240  9e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  61.58 
 
 
194 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  58.64 
 
 
195 aa  227  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  56.92 
 
 
196 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  57.59 
 
 
195 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  58.12 
 
 
195 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  61.46 
 
 
195 aa  222  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  57.14 
 
 
196 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  54.4 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  57.22 
 
 
196 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  58.55 
 
 
196 aa  216  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  56.77 
 
 
195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  57.65 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  55.12 
 
 
210 aa  214  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  55.1 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  56.25 
 
 
195 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  54.87 
 
 
197 aa  208  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  62.22 
 
 
199 aa  201  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  50.75 
 
 
201 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  53.44 
 
 
194 aa  191  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  56.36 
 
 
188 aa  175  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  50.76 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  47.62 
 
 
201 aa  166  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  49.21 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  44.79 
 
 
206 aa  153  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  43.23 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  44.67 
 
 
201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  43.62 
 
 
258 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  45.83 
 
 
195 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  40.93 
 
 
208 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  42.56 
 
 
213 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  37.62 
 
 
221 aa  121  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  38.46 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  39.79 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  31.71 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.93 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  32.43 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.38 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  33.52 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  27.12 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.34 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  32.61 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  23.78 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  24.6 
 
 
200 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  30 
 
 
211 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  27.75 
 
 
216 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  23.12 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  22.58 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  22.58 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  22.58 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  22.58 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  23.66 
 
 
208 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  22.45 
 
 
201 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  21.94 
 
 
201 aa  51.2  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  29.35 
 
 
221 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  22.04 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  22.57 
 
 
265 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  21.94 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.47 
 
 
330 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  25.68 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  30.67 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  25.15 
 
 
174 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  28.06 
 
 
217 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  27.37 
 
 
216 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  29.63 
 
 
170 aa  47.8  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  25.41 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  25.41 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  27.53 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  25.41 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  25.41 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  25.41 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  25.41 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  25.41 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  23.6 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  26.87 
 
 
205 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  27.78 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  28.92 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  25.13 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>