193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0935 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  98.46 
 
 		 195 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  89.23 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  68.21 
 
 		 195 aa  294  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  68.21 
 
 		 195 aa  292  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  61.14 
 
 		 196 aa  259  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  60.82 
 
 		 195 aa  248  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  62.3 
 
 		 202 aa  245  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  61.78 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  61.78 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  61.78 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  61.78 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  61.78 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  61.78 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  61.78 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  60.96 
 
 		 196 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  61.26 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  55.73 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  58.55 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  58.03 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  55.24 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  56.25 
 
 		 194 aa  234  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  54.17 
 
 		 196 aa  228  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  58.64 
 
 		 196 aa  227  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  53.65 
 
 		 196 aa  224  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  53.65 
 
 		 196 aa  224  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  53.65 
 
 		 196 aa  224  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  53.12 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  54.92 
 
 		 197 aa  221  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  51.56 
 
 		 196 aa  221  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  53.33 
 
 		 196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  56.63 
 
 		 195 aa  215  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  55.08 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  51.85 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  52.33 
 
 		 196 aa  204  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  49.74 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  51.81 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  48.7 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  49.49 
 
 		 199 aa  180  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  46.11 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  44.9 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  44.56 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  43.52 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  41.54 
 
 		 258 aa  158  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  47.85 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  44.27 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  38.66 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  37.95 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  38.66 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  37.76 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  36.22 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  33.15 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  34.54 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  32.07 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  31.05 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.22 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  28.5 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  24.71 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  27.78 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  30.23 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  24.14 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.61 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  30 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  30.77 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.44 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  29.07 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.37 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  29.63 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  25.14 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  28.4 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  28.4 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  25.54 
 
 		 246 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  28.36 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  27.95 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  26.37 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  35.96 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  27.33 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  24.46 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  24.46 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  24.46 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  27.63 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  25.84 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  29.01 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  27.36 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  22.65 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  24.46 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  30.87 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  23.91 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>