112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1009 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  86.67 
 
 		 195 aa  359  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  68.21 
 
 		 195 aa  295  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  68.21 
 
 		 195 aa  292  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  67.69 
 
 		 195 aa  291  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  63.02 
 
 		 196 aa  267  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  62.03 
 
 		 194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  60.31 
 
 		 195 aa  238  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  61.26 
 
 		 194 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  59.9 
 
 		 202 aa  233  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  58.85 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  58.85 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  58.85 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  58.85 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  58.85 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  58.85 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  58.85 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  56.68 
 
 		 196 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  50.52 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  56.77 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  54.36 
 
 		 196 aa  218  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  56.77 
 
 		 196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  50.52 
 
 		 196 aa  214  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  50.52 
 
 		 196 aa  214  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  51.81 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  51.43 
 
 		 210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  50 
 
 		 196 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  48.97 
 
 		 196 aa  210  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  48.97 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  49.48 
 
 		 196 aa  207  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  54.26 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  51.35 
 
 		 197 aa  201  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  51.01 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  51.28 
 
 		 197 aa  191  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  56.11 
 
 		 199 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  48.19 
 
 		 196 aa  188  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  45.55 
 
 		 196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  48.47 
 
 		 197 aa  181  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  46.35 
 
 		 194 aa  174  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  48.94 
 
 		 201 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  44.86 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  42.13 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  44.86 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  41.85 
 
 		 258 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  48.47 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  41.08 
 
 		 201 aa  144  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  41.67 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  36.73 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  37.5 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  38.59 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  35.9 
 
 		 213 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  35 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  36.27 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  30.69 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.49 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  24.73 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  27.22 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  29.24 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  24.19 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  24.19 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  24.19 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  24.19 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  24.73 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  24.19 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.67 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  25.6 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  23.2 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  25.93 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  29.63 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  28.07 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  24.06 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  29.63 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.17 
 
 		 330 aa  48.5  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  24.88 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  23.12 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  28.49 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  24.72 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.27 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  20.75 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  29.01 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  29.01 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  26.8 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  29.01 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  29.01 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  27.81 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  29.01 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  26.18 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  25.36 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  28.25 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  25.87 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  22.4 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  25.77 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  23.32 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  24.83 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  29.03 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  25.61 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  24.64 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>