173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1853 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  93.3 
 
 
194 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  76.17 
 
 
194 aa  308  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  76.17 
 
 
194 aa  308  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  76.17 
 
 
202 aa  309  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  76.17 
 
 
194 aa  308  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  76.17 
 
 
194 aa  308  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  76.17 
 
 
194 aa  308  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  76.17 
 
 
194 aa  308  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  76.17 
 
 
194 aa  308  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  74.35 
 
 
195 aa  298  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  62.5 
 
 
196 aa  259  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  62.5 
 
 
196 aa  258  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  62.5 
 
 
196 aa  258  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  62.5 
 
 
196 aa  258  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  61.98 
 
 
196 aa  257  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  61.98 
 
 
196 aa  257  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  61.98 
 
 
196 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  62.18 
 
 
197 aa  255  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  61.98 
 
 
196 aa  254  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  60.94 
 
 
196 aa  252  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  64.4 
 
 
196 aa  252  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  65.97 
 
 
196 aa  251  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  60.62 
 
 
196 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  59.07 
 
 
196 aa  246  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  61.46 
 
 
195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  62.03 
 
 
195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  59.79 
 
 
194 aa  241  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  57.69 
 
 
210 aa  238  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  58.03 
 
 
195 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  58.03 
 
 
195 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  55.73 
 
 
218 aa  235  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  57.81 
 
 
195 aa  234  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  59.9 
 
 
196 aa  229  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  59.59 
 
 
197 aa  226  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  63.89 
 
 
199 aa  221  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  55.96 
 
 
196 aa  218  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  56.12 
 
 
201 aa  214  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  54.17 
 
 
196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  56.99 
 
 
195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  193  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  51.32 
 
 
197 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  51.04 
 
 
197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  50.31 
 
 
188 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  42.56 
 
 
201 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  45.41 
 
 
195 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  43.24 
 
 
208 aa  141  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  41.12 
 
 
203 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  40.41 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  38.95 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  38.5 
 
 
208 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  39.47 
 
 
206 aa  125  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  35.87 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  34.76 
 
 
213 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  33.16 
 
 
221 aa  98.2  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  34.02 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.48 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  27.94 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  27.54 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  31.22 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.81 
 
 
200 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.91 
 
 
330 aa  61.2  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.61 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  24.86 
 
 
179 aa  58.9  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  23.76 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  29.38 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  23.2 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  28.35 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  23.76 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.5 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  26.44 
 
 
202 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  23.2 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  23.2 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  23.2 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  23.2 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.8 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  27.61 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  28.57 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  31.11 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  26.49 
 
 
205 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  25.93 
 
 
205 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  25.93 
 
 
205 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  26.63 
 
 
221 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  24.84 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  28.57 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  27.87 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  23.7 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  25.4 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  26.03 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  24.73 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  25.4 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  25.82 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  25.88 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  28.09 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  24.51 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.32 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  31.33 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  24.44 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  23.4 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  23.7 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>