83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0678 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  100 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  50.76 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  46.8 
 
 
258 aa  191  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  49.75 
 
 
213 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  51.74 
 
 
201 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  49.75 
 
 
208 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  49.22 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  48.47 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  46.15 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  48.42 
 
 
203 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  44.56 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  44.56 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  44.56 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  44.56 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  44.56 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  44.56 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  44.56 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  43.75 
 
 
195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  45.83 
 
 
196 aa  161  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  43.3 
 
 
202 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  44.5 
 
 
195 aa  157  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  44.79 
 
 
196 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  40.19 
 
 
210 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  41.33 
 
 
194 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  43.88 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  44.27 
 
 
196 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  41.62 
 
 
196 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  37.7 
 
 
197 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  38.66 
 
 
195 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  38.95 
 
 
196 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  43.33 
 
 
201 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  38.22 
 
 
195 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  40.31 
 
 
195 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  41.71 
 
 
196 aa  141  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  38.14 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  39.29 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  38.42 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  37.89 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  37.37 
 
 
196 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  37.37 
 
 
196 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  37.37 
 
 
196 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  37.37 
 
 
196 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  37.37 
 
 
196 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  37.89 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  37.57 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  37.43 
 
 
196 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  39.9 
 
 
194 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  36.92 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  42.62 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  38.02 
 
 
197 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  39.47 
 
 
194 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  36.22 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  36.94 
 
 
188 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  23.47 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  29.56 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  46.43 
 
 
546 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.97 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  23.66 
 
 
270 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  23.66 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  33.33 
 
 
246 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.26 
 
 
330 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  27.12 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  34.12 
 
 
167 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  26.5 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  28.99 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  27.12 
 
 
246 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  28.5 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  24.31 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  22.35 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  34.43 
 
 
171 aa  42.4  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  22.35 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  19.91 
 
 
265 aa  42.4  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  39.13 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  27.68 
 
 
217 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  26.29 
 
 
217 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  41.67 
 
 
224 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  27.68 
 
 
217 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  24.35 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  30.05 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>