214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3535 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  52.08 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  50.54 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  47.89 
 
 
208 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  50 
 
 
195 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  48.42 
 
 
206 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  44.79 
 
 
196 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  43.98 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  43.98 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  43.98 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  43.98 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  43.98 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  44.04 
 
 
196 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  43.98 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  43.46 
 
 
196 aa  161  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  44.1 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  45.74 
 
 
196 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  48.9 
 
 
201 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  44.22 
 
 
196 aa  154  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  41.62 
 
 
195 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  44.62 
 
 
208 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  42.64 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  42.64 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  42.13 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  43.23 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  42.64 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  42.64 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  42.64 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  42.64 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  42.64 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  43.22 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  40.1 
 
 
197 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  43.65 
 
 
195 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  45.31 
 
 
201 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  41.12 
 
 
202 aa  148  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  43.17 
 
 
213 aa  147  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  40.39 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  37.17 
 
 
196 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  43.43 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  41.41 
 
 
195 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  42.63 
 
 
194 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  37.81 
 
 
195 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  37.95 
 
 
195 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  40.96 
 
 
196 aa  141  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  42.41 
 
 
194 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  36.92 
 
 
195 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  41.12 
 
 
194 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  37.31 
 
 
196 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  43.22 
 
 
201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  36.04 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  42.44 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  40.11 
 
 
199 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  38.95 
 
 
194 aa  127  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  38.62 
 
 
197 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  32.65 
 
 
218 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  38.42 
 
 
197 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  30.37 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  29.49 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  29.35 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.07 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  33.7 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  27.41 
 
 
208 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  29.83 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  32.42 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  21.39 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  26.5 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  26.4 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  26.4 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  26.4 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  26.9 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  26.4 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  27.62 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  21.39 
 
 
201 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  25.13 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  29.65 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  25.27 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  30.11 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  27.42 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.14 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  29.07 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.42 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  30.05 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  31.33 
 
 
197 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  31.91 
 
 
199 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  30.06 
 
 
197 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  28.04 
 
 
215 aa  54.7  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  30.05 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  24.19 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  24.19 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  31.33 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  31.33 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  31.33 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  31.33 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  31.33 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  31.33 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  31.33 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  29.02 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  29.02 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.82 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>