134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1290 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  56.19 
 
 		 201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  57.59 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  49.75 
 
 		 197 aa  211  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  53.06 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  54.87 
 
 		 196 aa  208  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  55.61 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  55.61 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  55.61 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  55.61 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  55.61 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  55.61 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  55.61 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  54.55 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  50.26 
 
 		 195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  46.19 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  48.45 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  47.72 
 
 		 196 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  47.21 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  47.72 
 
 		 196 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  47.72 
 
 		 196 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  47.21 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  47.21 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  47.72 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  48.51 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  46.7 
 
 		 196 aa  191  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  49.74 
 
 		 195 aa  190  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  48.7 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  48.7 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  46.19 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  47.67 
 
 		 195 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  50.26 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  44.16 
 
 		 196 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  51.32 
 
 		 194 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  48.47 
 
 		 195 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  50.26 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  45.5 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  48.22 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  50.54 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  45.88 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  46.15 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  46.19 
 
 		 196 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  46.15 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  44.39 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  44.33 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  45.18 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  43.98 
 
 		 258 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  44.9 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  45.88 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  43.23 
 
 		 197 aa  154  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  42.86 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  49.18 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  37.77 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  45.96 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  38.76 
 
 		 201 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  37.89 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.28 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  29.02 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  26.37 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  26.37 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  26.37 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  26.37 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  26.37 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  25.82 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  28.96 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  25.27 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  30.19 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  29.19 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  30 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  26.11 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  26.11 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  28.24 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  26.11 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  26.11 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  26.11 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  33.8 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  25.41 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  23.33 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  28.87 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  25 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  27.89 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  25 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  25 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  27.59 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  27.59 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  27.59 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  27.12 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  27.59 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  30.34 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  27.08 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  27.59 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  27.37 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  27.59 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>