119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2070 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  67.66 
 
 
201 aa  275  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  64.06 
 
 
195 aa  242  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  63.02 
 
 
202 aa  238  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  61.98 
 
 
194 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  61.98 
 
 
194 aa  233  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  61.98 
 
 
194 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  61.98 
 
 
194 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  61.98 
 
 
194 aa  233  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  61.98 
 
 
194 aa  233  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  61.98 
 
 
194 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  56.35 
 
 
196 aa  231  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  60.62 
 
 
194 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  59.59 
 
 
194 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  57.07 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  57.14 
 
 
196 aa  216  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  57.65 
 
 
196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  55.84 
 
 
196 aa  214  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  55.5 
 
 
196 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  55.5 
 
 
196 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  51.55 
 
 
196 aa  208  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  54.97 
 
 
196 aa  208  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  54.97 
 
 
196 aa  208  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  54.97 
 
 
196 aa  208  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  54.45 
 
 
196 aa  204  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  54.45 
 
 
196 aa  204  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  53.93 
 
 
196 aa  204  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  52.33 
 
 
195 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  54.55 
 
 
194 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  51.74 
 
 
210 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  52.33 
 
 
195 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  53.61 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  51.81 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  51.81 
 
 
195 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  50.76 
 
 
196 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  51.28 
 
 
195 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  51.6 
 
 
196 aa  187  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  49.75 
 
 
197 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  46.67 
 
 
218 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  49.22 
 
 
196 aa  177  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  53.01 
 
 
188 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  45.45 
 
 
194 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  52.25 
 
 
199 aa  157  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  43.23 
 
 
197 aa  154  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  42.33 
 
 
201 aa  148  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  42.16 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  39.69 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  42.93 
 
 
258 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  41.67 
 
 
195 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  38.02 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  38.42 
 
 
203 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  35.64 
 
 
213 aa  115  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  33.33 
 
 
208 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  34.95 
 
 
201 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  36.55 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  91.7  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  28.41 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  25.15 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  30.52 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  24.32 
 
 
200 aa  55.1  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.95 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  23.72 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  23.72 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.84 
 
 
206 aa  51.2  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  25 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  27.41 
 
 
204 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  26.59 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  28.42 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.32 
 
 
206 aa  48.9  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  25 
 
 
205 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  25 
 
 
205 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  23.73 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  24.29 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  24.29 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  24.29 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  25 
 
 
208 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  25.95 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  26.14 
 
 
221 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  24.29 
 
 
212 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  23.73 
 
 
212 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  24.29 
 
 
212 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  25.55 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  25.55 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  25.55 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  23.73 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  25.55 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  27.67 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  24.4 
 
 
205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  26.28 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  24.4 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  24.55 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  26.28 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.97 
 
 
217 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  22.56 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  24.83 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  23.81 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  22.99 
 
 
181 aa  44.7  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  26.71 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  24.83 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  23.81 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>