122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0129 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  86.57 
 
 
201 aa  329  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  51.06 
 
 
258 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  50 
 
 
208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  52.06 
 
 
195 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  45.45 
 
 
201 aa  167  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  47.24 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  45.03 
 
 
201 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  43.39 
 
 
206 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  38.62 
 
 
197 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  39.89 
 
 
196 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  38.34 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  37.97 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  37.31 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  37.06 
 
 
213 aa  131  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  35.79 
 
 
196 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  35.79 
 
 
196 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  35.26 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  35.26 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  35.26 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  37.77 
 
 
196 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  37.82 
 
 
195 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  35.79 
 
 
196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  35.26 
 
 
196 aa  128  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  35.26 
 
 
196 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  36.79 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  38.83 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  38.83 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  37.77 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  38.83 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  38.83 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  38.83 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  38.83 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  38.83 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  38.74 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  36.13 
 
 
196 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  33.68 
 
 
195 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  32.99 
 
 
195 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  36.02 
 
 
197 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  32.47 
 
 
195 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  36.08 
 
 
202 aa  121  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  32.68 
 
 
210 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  37.17 
 
 
196 aa  121  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  35.71 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  31.79 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  33.67 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  33.51 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  34.54 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  35.48 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  34.54 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  36.84 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  35.85 
 
 
188 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  34.72 
 
 
197 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  40.12 
 
 
199 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  32.28 
 
 
194 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  29.02 
 
 
218 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  31.05 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  25.13 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  27.51 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  27.66 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  27.66 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  27.66 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  27.66 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  27.66 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  27.66 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  27.85 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  27.66 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  27.66 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  27.66 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  27.66 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  24.21 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  26.46 
 
 
211 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  23.94 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  24.57 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  24 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  24 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  24 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  26.06 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  24 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  24.73 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  25.4 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  24.57 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  24 
 
 
207 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  28.82 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  26.51 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  25.4 
 
 
217 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  25.42 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  29.22 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  29.22 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  29.22 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  29.22 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  29.22 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  25.4 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  22.78 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.83 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  25.45 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  26.62 
 
 
204 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>