128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16880 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  54.76 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  48.58 
 
 		 258 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  49.24 
 
 		 208 aa  194  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  49.75 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  49.24 
 
 		 201 aa  187  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  50.78 
 
 		 201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  49.24 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  47.89 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  46.15 
 
 		 197 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  43.17 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  41.97 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  39.29 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  42.56 
 
 		 196 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  37.76 
 
 		 195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  37.24 
 
 		 195 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  39.59 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  38.78 
 
 		 195 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  38.5 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  39.57 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  38.95 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  37 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  38.62 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  37.17 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  38.65 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  35.9 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  36.17 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  35.96 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  35.89 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  38.69 
 
 		 194 aa  121  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  38.04 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  37.42 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  38.04 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  37.42 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  37.42 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  37.42 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  38.04 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  37.42 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  36.51 
 
 		 194 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  35.64 
 
 		 197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  38.62 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  35.53 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  34.76 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  31.02 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  36.02 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  38.89 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.17 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  28.57 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  28.57 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  22.82 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  28.14 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  36.05 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.25 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  26.4 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  25.28 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  28.57 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  26.77 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  29.09 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  29.09 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  25.26 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  25.84 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  29.09 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  27.86 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  25.28 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  29.09 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  26.62 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  18.23 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  21.2 
 
 		 270 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  21.2 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  24.67 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  27.97 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  27.86 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  33.66 
 
 		 347 aa  45.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.27 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  34.41 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  30 
 
 		 170 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  27.97 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  33.33 
 
 		 275 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  36.36 
 
 		 272 aa  45.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  23.94 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  23.2 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  23.4 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  31.58 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>