102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5204 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  54.79 
 
 		 195 aa  214  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  55.21 
 
 		 196 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  55.08 
 
 		 195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  52.04 
 
 		 197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  54.55 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  54.59 
 
 		 196 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  55.08 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  51.02 
 
 		 196 aa  205  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  51.46 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  54.26 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  52.58 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  52.58 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  52.58 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  52.06 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  51.3 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  52.06 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  52.06 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  52.06 
 
 		 196 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  51.55 
 
 		 196 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  53.51 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  48.97 
 
 		 196 aa  191  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  54.92 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  53.4 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  51.56 
 
 		 194 aa  187  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  48.98 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  51.04 
 
 		 194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  52.33 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  52.33 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  52.33 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  52.33 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  52.33 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  52.33 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  52.33 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  52.33 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  52.04 
 
 		 196 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  49.75 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  50.76 
 
 		 196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  54.59 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  53.59 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  46.52 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  44.39 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  44.5 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  46.2 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  48.17 
 
 		 188 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  40.21 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  39.06 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  39.46 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  37.63 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  38.62 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  36.22 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  37.82 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  36.26 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  36.6 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  38.62 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  34.34 
 
 		 221 aa  107  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  34.69 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  27.51 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  30.3 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.62 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.62 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27.62 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  27.07 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  29.19 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  27.07 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  27.81 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  26.95 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27.07 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  31.41 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  24.39 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  29.26 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  29.71 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  23.78 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  28.48 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  29.09 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  24.75 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.66 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  24.47 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  24.47 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  27.84 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  31.11 
 
 		 315 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  26.67 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  23.94 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  25.44 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  27.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  23.4 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  23.94 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  24.86 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  23.4 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  25.56 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.62 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  22.78 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  27.07 
 
 		 200 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  25 
 
 		 200 aa  42  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  31.29 
 
 		 211 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  23.37 
 
 		 204 aa  42  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  23.4 
 
 		 205 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  27.27 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  25.61 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  31.43 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>