210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5658 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  63.92 
 
 		 195 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  58.76 
 
 		 208 aa  235  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  56.37 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  56.57 
 
 		 201 aa  216  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  56.19 
 
 		 197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  51.74 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  49.24 
 
 		 213 aa  187  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  52.08 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  43.52 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  46.73 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  46.73 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  46.73 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  46.73 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  46.73 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  46.73 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  46.73 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  47.09 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  47.37 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  47.62 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  46.35 
 
 		 195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  44.72 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  47.78 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  44.79 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  43.52 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  45.5 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  43.85 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  41.75 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  41.75 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  41.75 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  41.75 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  42.49 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  41.75 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  41.75 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  41.75 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  42.49 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  41.24 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  42.56 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  43.88 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  42.56 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  39.47 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  39.9 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  42.56 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  39.61 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  43.65 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  39.69 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  41.08 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  40.41 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  41.08 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  39.29 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  39.06 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  42.7 
 
 		 188 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  42.78 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  42.62 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  34 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  25.25 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  33.33 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  28.64 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  27.87 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  25.54 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  25.54 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  25.54 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  25.54 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.48 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  32.69 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  32.69 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  32.69 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  32.69 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  32.69 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  25.54 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  25 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  26.78 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  32.05 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  32.05 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  25 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  30.36 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  29.75 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  32.05 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  31.21 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  31.06 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  28.71 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  26.6 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  25.99 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  29.87 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  29.15 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  28.71 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  24.71 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  26.6 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  32.65 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  26.6 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.01 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  26.6 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  26.6 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  26.06 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  25.82 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  28.64 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  27.08 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  36.56 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  26.6 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>