96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00764 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  457  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  60 
 
 		 196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  59.49 
 
 		 196 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  59.49 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  59.49 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  59.49 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  58.97 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  58.97 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  58.46 
 
 		 196 aa  248  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  55.73 
 
 		 195 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  56.77 
 
 		 196 aa  238  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  54.69 
 
 		 195 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  55.73 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  56.25 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  54.69 
 
 		 195 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  53.12 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  50.52 
 
 		 195 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  54.4 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  53.4 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  54.45 
 
 		 202 aa  218  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  53.93 
 
 		 194 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  53.93 
 
 		 194 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  53.93 
 
 		 194 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  53.93 
 
 		 194 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  53.93 
 
 		 194 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  53.93 
 
 		 194 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  53.93 
 
 		 194 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  53.93 
 
 		 195 aa  215  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  53.89 
 
 		 197 aa  215  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  214  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  56.04 
 
 		 199 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  51.85 
 
 		 196 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  52.08 
 
 		 196 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  50.52 
 
 		 196 aa  205  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  49.76 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  51.3 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  46.88 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  47.67 
 
 		 196 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  46.67 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  48.7 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  45.45 
 
 		 201 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  37.77 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  40.66 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  43.48 
 
 		 188 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  37.57 
 
 		 258 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  32.65 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  37.16 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  28.85 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  34 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  33.33 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  30.81 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  36.07 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  31.02 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  29.89 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  27.98 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  25.89 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  25.89 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  25.38 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  25.38 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  25.38 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  25.38 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  24.37 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  24.87 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  24.87 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  28.65 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  25.81 
 
 		 174 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  23.94 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  21.51 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  26.35 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  24.32 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  26.54 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  22.29 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  22.86 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  20.97 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  21.43 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  22.75 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  24.37 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  25.95 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  25 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  23.68 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  23.12 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  24.68 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  28.26 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  27.11 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  20.1 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  23.81 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  21.43 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  23.28 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  23.53 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  24.46 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  20.93 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  26 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  24.68 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  25.68 
 
 		 218 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.54 
 
 		 330 aa  41.6  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>