109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2381 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  67.66 
 
 		 197 aa  275  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  58.67 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  58.67 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  58.67 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  58.67 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  58.67 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  58.67 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  58.67 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  58.16 
 
 		 195 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  58.16 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  56.12 
 
 		 194 aa  214  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  56.12 
 
 		 194 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  53.57 
 
 		 196 aa  208  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  53.23 
 
 		 196 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  52.24 
 
 		 197 aa  204  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  52.04 
 
 		 196 aa  201  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  52.04 
 
 		 196 aa  201  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  51.53 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  51.53 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  51.53 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  51.02 
 
 		 196 aa  197  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  50.51 
 
 		 196 aa  197  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  51.02 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  53.81 
 
 		 195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  49.74 
 
 		 196 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  50.75 
 
 		 196 aa  192  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  49.24 
 
 		 196 aa  184  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  48.08 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  48.76 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  45.45 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  46.6 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  46.5 
 
 		 196 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  45.92 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  44.9 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  44.39 
 
 		 195 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  48.94 
 
 		 195 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  44.27 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  53.29 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  51.6 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  44.5 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  42.86 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  41.67 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  40.39 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  38.69 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  39.7 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  39.29 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  39.8 
 
 		 258 aa  134  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  36.92 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  37.04 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  37.1 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  30.57 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  33.33 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  31.82 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  34.72 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  25.14 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  31.12 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  25.14 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  25.14 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  25.14 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  25.14 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  25.14 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  24.59 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  28.5 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  27.38 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27.52 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  26.54 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.52 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27.52 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  26.54 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  28.77 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  29.24 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  30.46 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  28.11 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  34.27 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  26.85 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  26.85 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  26.17 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.01 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  26.22 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.94 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  26.46 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  23.53 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  25.19 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  24.19 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  24.87 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  26.22 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  26.22 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  24.66 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  26.22 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  26.22 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  26.22 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  29.73 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  22.07 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  27.03 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  26.22 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  26.22 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  22.5 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  22.5 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>