134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1131 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  58.68 
 
 
195 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  50.77 
 
 
196 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  54.55 
 
 
194 aa  175  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  56.36 
 
 
196 aa  175  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  53.53 
 
 
196 aa  174  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  54.6 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  54.6 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  54.6 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  54.6 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  54.6 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  54.6 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  54.6 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  51.16 
 
 
196 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  53.99 
 
 
195 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  53.99 
 
 
202 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  49.43 
 
 
210 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  53.01 
 
 
197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  49.7 
 
 
197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  53.29 
 
 
201 aa  161  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  50.31 
 
 
194 aa  157  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  48.77 
 
 
196 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  49.08 
 
 
195 aa  154  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  48.77 
 
 
196 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  48.77 
 
 
196 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  48.77 
 
 
196 aa  153  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  48.77 
 
 
196 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  49.08 
 
 
194 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  48.77 
 
 
196 aa  153  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  47.85 
 
 
195 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  47.85 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  48.15 
 
 
196 aa  151  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  48.17 
 
 
197 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  49.08 
 
 
195 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  47.53 
 
 
196 aa  148  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  49.09 
 
 
196 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  48.15 
 
 
196 aa  148  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  47.62 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  45.96 
 
 
197 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  48.47 
 
 
195 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  49.4 
 
 
194 aa  145  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  46.34 
 
 
196 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  43.48 
 
 
218 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  42.7 
 
 
201 aa  131  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  42.44 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  42.11 
 
 
258 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  40.12 
 
 
208 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  47.65 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  40.59 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  38.3 
 
 
221 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  35.85 
 
 
201 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  36.94 
 
 
206 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  36.02 
 
 
213 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  33.93 
 
 
208 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  34.81 
 
 
195 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  27.47 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  27.47 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  27.47 
 
 
217 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  27.47 
 
 
217 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  27.47 
 
 
217 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  26.92 
 
 
217 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  32.43 
 
 
211 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  27.47 
 
 
217 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  29.61 
 
 
218 aa  58.2  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  28.49 
 
 
217 aa  57.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  27.47 
 
 
217 aa  58.2  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  28.98 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  26.92 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  32.2 
 
 
216 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  32.5 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  26.71 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  27.33 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  26.71 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  26.71 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  25.73 
 
 
216 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  27.32 
 
 
217 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  28.74 
 
 
205 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  24.73 
 
 
218 aa  51.2  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  27.27 
 
 
217 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  24.32 
 
 
200 aa  51.2  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.13 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  28.16 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  26.74 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  26.74 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  25.86 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  27.51 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  25.52 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  27.5 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  25.67 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  26.6 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  25.13 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  26.06 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  26.7 
 
 
217 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  27.01 
 
 
217 aa  47.8  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  27.01 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  26.67 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  27.01 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  23.63 
 
 
213 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  26.44 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>