245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8440 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  81.37 
 
 
211 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  78.92 
 
 
211 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  46.04 
 
 
204 aa  191  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  46.04 
 
 
204 aa  191  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  43.78 
 
 
214 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  39.9 
 
 
204 aa  181  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  42.35 
 
 
211 aa  167  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  33.17 
 
 
213 aa  122  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  32.32 
 
 
213 aa  121  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  34.38 
 
 
200 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  34.92 
 
 
202 aa  115  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  33.84 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  33.84 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  32.16 
 
 
202 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  36.13 
 
 
200 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  34.03 
 
 
200 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  30.24 
 
 
212 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  31 
 
 
201 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  25.98 
 
 
207 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  28.41 
 
 
212 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  31.03 
 
 
204 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  25.98 
 
 
208 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  25.49 
 
 
207 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  25.49 
 
 
207 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  25.49 
 
 
207 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  32.84 
 
 
213 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  25.49 
 
 
208 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  25.49 
 
 
207 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  29.76 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  27.94 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  29.76 
 
 
212 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  30.24 
 
 
212 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  30.24 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  29.76 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  27.94 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  27.94 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  29.76 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  27.94 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  27.94 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  27.94 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  27.94 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  29.76 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  27.04 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  29.76 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  29.76 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  29.27 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  27.5 
 
 
202 aa  94.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  30.39 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  28.57 
 
 
200 aa  92  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  27.64 
 
 
200 aa  91.7  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  48.48 
 
 
395 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  27.23 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  29.47 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  32.62 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  28.73 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  24.54 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  24.19 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  24.34 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  30.81 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  21.39 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  30.1 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  32.37 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  28.28 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  25.99 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  25.12 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  25 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  23.16 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  27.57 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.39 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  30.43 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  28.86 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.13 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  23.72 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  25.52 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  24.51 
 
 
188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  24.51 
 
 
188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.35 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.35 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  23.22 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  25.96 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  30.49 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  30.29 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  30.29 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  27.06 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  30.29 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  30.29 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  30.29 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  30.29 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  30.29 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.71 
 
 
220 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  28.11 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  23.83 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  26.09 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  24.35 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  31.25 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  23.26 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  27.69 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  26.92 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  24.26 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>