179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1774 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  65.61 
 
 
202 aa  255  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  65.08 
 
 
194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  65.08 
 
 
194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  65.08 
 
 
194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  65.08 
 
 
194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  65.08 
 
 
194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  65.08 
 
 
194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  65.08 
 
 
194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  65.96 
 
 
195 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  61.86 
 
 
194 aa  249  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  60.85 
 
 
196 aa  248  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  61.86 
 
 
194 aa  248  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  60.85 
 
 
196 aa  247  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  60.85 
 
 
196 aa  247  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  60.85 
 
 
196 aa  247  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  60.32 
 
 
196 aa  246  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  60.32 
 
 
196 aa  246  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  59.79 
 
 
196 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  59.79 
 
 
196 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  59.07 
 
 
197 aa  241  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  59.79 
 
 
194 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  60.32 
 
 
196 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  57.45 
 
 
196 aa  237  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  61.58 
 
 
196 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  56.48 
 
 
196 aa  235  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  59.42 
 
 
210 aa  234  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  56.25 
 
 
195 aa  234  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  60.85 
 
 
196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  55.21 
 
 
195 aa  231  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  55.44 
 
 
195 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  56.48 
 
 
196 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  53.12 
 
 
218 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  56.84 
 
 
196 aa  222  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  62.64 
 
 
199 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  51.81 
 
 
195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  51.04 
 
 
195 aa  207  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  54.55 
 
 
197 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  50.26 
 
 
196 aa  197  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  50.26 
 
 
195 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  53.51 
 
 
197 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  50.26 
 
 
197 aa  180  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  54.55 
 
 
188 aa  175  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  44.27 
 
 
201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  42.56 
 
 
201 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  41.33 
 
 
206 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  44.56 
 
 
201 aa  148  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  39.59 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  42.56 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  42.64 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  42.63 
 
 
203 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  39.58 
 
 
208 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  39.59 
 
 
213 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  35.71 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  33.15 
 
 
201 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  34.03 
 
 
201 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.57 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  30.17 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  28.48 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  24.43 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  24.43 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  22.22 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  24.43 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  24.43 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  24.43 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  24.43 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  22.22 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  23.86 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.93 
 
 
179 aa  59.3  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  27.75 
 
 
233 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  23.96 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  28.32 
 
 
204 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  27.66 
 
 
209 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  30.87 
 
 
211 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  23.04 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  25.57 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  23.04 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  23.96 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  23.04 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  26.9 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  23.04 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.84 
 
 
227 aa  52.8  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  25.91 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  28.34 
 
 
201 aa  52  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  25.74 
 
 
217 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  25.39 
 
 
202 aa  52  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  27.57 
 
 
212 aa  51.6  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  27.22 
 
 
221 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  24.14 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  23.26 
 
 
212 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  23.44 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  22.16 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  25.74 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  22.16 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  25.77 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  26.86 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  23.33 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  23.21 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  23.44 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  23.04 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>