275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5169 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  100 
 
 
211 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  83.89 
 
 
211 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  78.92 
 
 
205 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  46.89 
 
 
214 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  41.38 
 
 
204 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  44 
 
 
204 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  43 
 
 
204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  39.52 
 
 
211 aa  170  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  31.98 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  33.33 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  34.83 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  34.33 
 
 
202 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  31.61 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  31.03 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  30.39 
 
 
200 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  31.58 
 
 
212 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  32.46 
 
 
212 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  31.58 
 
 
212 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  35.68 
 
 
200 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  29.9 
 
 
200 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  31.1 
 
 
212 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  30.11 
 
 
212 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  31.1 
 
 
212 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  29.85 
 
 
200 aa  104  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  31.58 
 
 
212 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  30.35 
 
 
200 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  30.62 
 
 
212 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  31.1 
 
 
212 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  33.16 
 
 
200 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  27.84 
 
 
205 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  30.65 
 
 
199 aa  98.2  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  26.57 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  28.79 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  30.94 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  26.7 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  26.7 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  25.82 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  25.82 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  25.82 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  25.82 
 
 
205 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  25.82 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  25.82 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  25.82 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  27.92 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  30.77 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  29.28 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  26.37 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  30.88 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  44 
 
 
395 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  26.13 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  23.58 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  26.05 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  31.18 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  26.98 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  21.78 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  25.35 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  26.4 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  22.7 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  29.91 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  25.48 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  25.48 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  24.45 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  26.21 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  24.07 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.15 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  25.6 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  24.48 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.14 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  32.02 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  25.13 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.34 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.34 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.34 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  29.35 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.48 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  28.18 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  24.34 
 
 
227 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  24.76 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  30.69 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  30 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  22.02 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  21.76 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  23.53 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  23.89 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  35.21 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  22.58 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  32.42 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  28.8 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  28.8 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  28.8 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  29.19 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  28.8 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  23.44 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  33.71 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>