200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3854 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  63.45 
 
 		 208 aa  254  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  62.12 
 
 		 195 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  60.59 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  56.57 
 
 		 201 aa  216  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  50.78 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  49.22 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  47.64 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  45.18 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  45.55 
 
 		 195 aa  157  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  45.55 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  44.67 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  44.27 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  42.55 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  42.55 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  40.84 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  42.02 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  43.75 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  42.02 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  42.02 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  44.75 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  45.31 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  42.33 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  46.35 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  43.46 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  44.56 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  42.02 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  41.49 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  40.96 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  43.75 
 
 		 195 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  40.78 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  40.11 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  42.16 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  41.58 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  40.21 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  39.7 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  40.62 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  40.62 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  40.62 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  40.62 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  40.62 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  40.62 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  40.62 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  41.36 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  40.93 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  40.41 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  42.42 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  39.06 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  36.56 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  39.46 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  37.16 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  43.41 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  39.69 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  40.59 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  30.46 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  24.46 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  28.14 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  25.91 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  28.14 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  28.14 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  28.14 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  28.14 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  28.14 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  28.14 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  28.14 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  27.14 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  28.14 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.85 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  26.09 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  26.88 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  26.77 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  27.14 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  26.73 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  27.57 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  26.26 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  27.93 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  25.13 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.38 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  27.14 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  28.11 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  24.58 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  27.22 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  31.33 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  29.89 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  22.84 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.43 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  24.87 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  24.04 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  24.06 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  30.77 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  28.31 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  28.87 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  28.48 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  24.04 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  27.88 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  27.45 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  23.38 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  27.01 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>