More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5933 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  95 
 
 
200 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  61 
 
 
202 aa  270  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  54 
 
 
200 aa  239  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  57.65 
 
 
202 aa  226  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  53 
 
 
199 aa  221  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  48 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  47.5 
 
 
213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  48 
 
 
204 aa  207  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  45.5 
 
 
202 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  43.5 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  43 
 
 
200 aa  197  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  40 
 
 
200 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  40 
 
 
200 aa  177  8e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  39 
 
 
201 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  40.91 
 
 
201 aa  160  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  39.36 
 
 
214 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  33.66 
 
 
204 aa  124  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  37.25 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  36.13 
 
 
205 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  35.1 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  34.01 
 
 
213 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  36.27 
 
 
204 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  35.68 
 
 
211 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  33.49 
 
 
213 aa  106  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  34.69 
 
 
211 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  30.61 
 
 
212 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  30.65 
 
 
212 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  28.85 
 
 
208 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  28.37 
 
 
207 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  28.37 
 
 
207 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  28.37 
 
 
207 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  28.37 
 
 
207 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  28.85 
 
 
207 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  29.35 
 
 
212 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  28.37 
 
 
208 aa  99  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  32.26 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  34.83 
 
 
206 aa  99  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  29.8 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  29.8 
 
 
212 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  31.13 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  29.9 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  29.29 
 
 
212 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  28.36 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  28.79 
 
 
212 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  29.57 
 
 
205 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  29.57 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  29.57 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  29.57 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  29.57 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  29.57 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  29.57 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  29.03 
 
 
205 aa  89  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  29.57 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  29.03 
 
 
205 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  27.87 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  31.75 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  30.39 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  28.34 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  27.55 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  28.86 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  28.71 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  32.22 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  29.57 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  28.08 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0456  nitroreductase  26.16 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  26.44 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  26.4 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  26.4 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  28.16 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  27.96 
 
 
265 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  26.47 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  28.78 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  30.99 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  25.14 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  27.27 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  26.53 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  29.25 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  28.92 
 
 
242 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  30 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  27.83 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  25.85 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  27.59 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.79 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  27.23 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05892  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.51 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  26.13 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  25.35 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  25.35 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  27.54 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  27.32 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  27.14 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  27.32 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  26.63 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.5 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  28.66 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  27.44 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  27.93 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.14 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  25.11 
 
 
261 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>