224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4012 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  100 
 
 		 233 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  75.96 
 
 		 211 aa  330  8e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  75.48 
 
 		 210 aa  326  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  71.15 
 
 		 212 aa  308  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  65.87 
 
 		 211 aa  284  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  63.59 
 
 		 210 aa  282  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  53.85 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  53.85 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  49.28 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  46.89 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  45.89 
 
 		 216 aa  181  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  36.41 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  41.26 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  36.76 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  37.8 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  37.68 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  33.64 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  33.18 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  34.29 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  35.27 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  35.71 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  37.62 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  34.27 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  33.85 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  33.8 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  32.24 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  32.88 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  27.04 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  30.41 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  36.89 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  32.06 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  33.18 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  29.29 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  30.21 
 
 		 209 aa  99  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  31.86 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  28.11 
 
 		 217 aa  99  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  30.45 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  33.17 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  27.75 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  26.79 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  29.03 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  28.3 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  28.35 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.07 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.07 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  26.32 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.07 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  28.3 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  31.25 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  28.91 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  30.93 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  26.76 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  27.23 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  25.59 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.9 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  30.88 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  27.14 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  29.33 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.59 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  26.89 
 
 		 217 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  24.64 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  26.89 
 
 		 217 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  26.89 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  26.89 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  27.1 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  30.14 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  29.17 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  26.98 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  27.44 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  28.78 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  26.98 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  26.27 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  29.46 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  29.86 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  27.44 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  29.36 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  27.5 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  27.45 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  27.03 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  27.31 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  25 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  29.49 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  25.76 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  27.98 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  25.76 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  28.57 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  26.85 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  25.24 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  25.24 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  25.24 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  28.77 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  24.77 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  28.91 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  24.76 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  24.4 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  27.56 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  25.58 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  26.98 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  29.28 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  32.76 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>