206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2693 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  100 
 
 
211 aa  430  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  53.03 
 
 
209 aa  214  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  50 
 
 
212 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  46.89 
 
 
233 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  47.85 
 
 
211 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  48.8 
 
 
210 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  44.98 
 
 
210 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  47.32 
 
 
210 aa  186  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  46.89 
 
 
211 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  44.28 
 
 
232 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  44.81 
 
 
210 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  39.13 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  42.58 
 
 
209 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  42.51 
 
 
216 aa  147  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  37.5 
 
 
214 aa  147  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  37.2 
 
 
210 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  38.1 
 
 
220 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  38.46 
 
 
215 aa  138  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  37.62 
 
 
215 aa  138  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  36.19 
 
 
219 aa  136  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  38.83 
 
 
216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  32.86 
 
 
224 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  33.98 
 
 
208 aa  134  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  35.58 
 
 
215 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  37.5 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  33.49 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  33.95 
 
 
222 aa  111  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  30.88 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  32.56 
 
 
223 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  36.13 
 
 
217 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  35.53 
 
 
217 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  34.58 
 
 
217 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  33.48 
 
 
223 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  33.48 
 
 
223 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  34.13 
 
 
217 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  32.71 
 
 
217 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  33.17 
 
 
199 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  32 
 
 
217 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  30.2 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  31.75 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  30.35 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  35.23 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.26 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  29.35 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.85 
 
 
227 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  31.56 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  30 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  29.15 
 
 
226 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  31.25 
 
 
209 aa  95.1  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.15 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.15 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  30.35 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.15 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  30.67 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  28.38 
 
 
217 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  31.9 
 
 
235 aa  91.3  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  32.31 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  31.88 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  28.38 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  31.55 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  29.56 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  28.12 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  27.65 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  28.12 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  28.12 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  31.07 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  28.12 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  28.36 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  32.57 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  26.53 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  31.37 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  26.53 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  28.57 
 
 
218 aa  85.1  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  26.02 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  30.89 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.98 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  28.35 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  34.1 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  30.73 
 
 
218 aa  82  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  28 
 
 
218 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  28.04 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  34.62 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  28.97 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  27.1 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  30.37 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  29.28 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  32.28 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  32.3 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  26.64 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  31.13 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  32.16 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  27.51 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  26.98 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  26.98 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  26.98 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  26.98 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  26.98 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  29.63 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  30.16 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  31.56 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>