270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3717 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  100 
 
 		 220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  57.14 
 
 		 217 aa  264  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  56.22 
 
 		 217 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  55.76 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  55.76 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  50.23 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  56.22 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  51.64 
 
 		 217 aa  238  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  52.58 
 
 		 217 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  51.64 
 
 		 217 aa  235  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  49.3 
 
 		 217 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  48.84 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  50.7 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  48.84 
 
 		 217 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  49.77 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  49.77 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  48.84 
 
 		 217 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  50.49 
 
 		 217 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  50.49 
 
 		 217 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  49.77 
 
 		 217 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  50.23 
 
 		 216 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  52.34 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  48.37 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  48.37 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  48.37 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  47.47 
 
 		 218 aa  221  6e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  47.91 
 
 		 217 aa  221  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  48.34 
 
 		 218 aa  221  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  47.91 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  47.44 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  59.13 
 
 		 216 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  47.91 
 
 		 217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  47.91 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  47.91 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  47.91 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  53.02 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  46.08 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  52.34 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  51.4 
 
 		 217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  35.65 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  34.45 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  33.97 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  35.55 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  32.55 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  34.29 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  30.73 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  33.66 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  31.82 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  34.27 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  30.91 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  29.77 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  34.09 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  30.52 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  30.67 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  30.59 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  30.49 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  29.28 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  32.57 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  27.03 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  32.68 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  29.36 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.19 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.23 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.19 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  27.48 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  28.24 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  29.95 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  29.15 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  28.44 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  28.18 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  28.23 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.46 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  29.86 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  28.1 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  31.22 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  27.01 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.52 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  26.57 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  27.62 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  25.91 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  27.52 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  28.77 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  29 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  25.65 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  27.78 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  29.73 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  27.78 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  27.44 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.04 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  27.93 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  28.97 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  26.83 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  26.19 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  26.67 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  26.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  26.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  26.07 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  29.58 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  28.05 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>