224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1158 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  100 
 
 
209 aa  436  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  45.37 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  47.09 
 
 
208 aa  194  7e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  46.41 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  46.89 
 
 
209 aa  179  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  46.89 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.35 
 
 
227 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  40 
 
 
226 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.07 
 
 
227 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.07 
 
 
227 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  39.07 
 
 
226 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  37.96 
 
 
227 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  38.6 
 
 
227 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.73 
 
 
220 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  39.07 
 
 
227 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  39.07 
 
 
227 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  42.58 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  39.15 
 
 
220 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  36.94 
 
 
223 aa  148  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  36.94 
 
 
223 aa  148  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  36.41 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  37.16 
 
 
218 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  38.05 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  40.72 
 
 
219 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  37.04 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  36.57 
 
 
222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  35.42 
 
 
215 aa  128  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  37.23 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  36.32 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  36.32 
 
 
201 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  36.32 
 
 
201 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  29.47 
 
 
202 aa  112  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  31.46 
 
 
224 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  31.58 
 
 
215 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  35.64 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  31.16 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  32.26 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  33.33 
 
 
235 aa  108  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  32.71 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  30.98 
 
 
214 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  33.15 
 
 
219 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  33.51 
 
 
209 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  33.33 
 
 
210 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  29.67 
 
 
206 aa  100  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  30.21 
 
 
233 aa  99  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  30.04 
 
 
218 aa  98.6  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  30.85 
 
 
211 aa  97.8  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  28.28 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  29.59 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  26.54 
 
 
224 aa  94.7  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  32.28 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  32.16 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  28.87 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  27.55 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  32.45 
 
 
210 aa  92  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  30.21 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  31.15 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  28.76 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  31.77 
 
 
232 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  24.19 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  27.43 
 
 
218 aa  88.6  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  27.68 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  29.23 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  26.87 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  27.06 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  29.1 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  32.37 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  28.71 
 
 
213 aa  84.7  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  26.19 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  25 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  29.53 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  29.3 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  27.83 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  26.19 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  29.44 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  26.19 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  25.25 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  28.97 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  26.05 
 
 
217 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  30.89 
 
 
217 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  26.98 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  23.74 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  28.04 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  25.35 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  29.84 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  29.12 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  25.52 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.63 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  25.93 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.27 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  25.35 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.52 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>