More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1731 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  34.36 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  33.85 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  30.05 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  27.86 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  29.32 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  29.59 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  26.4 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  33.33 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  28.89 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  29.84 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.7 
 
 		 227 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  30.69 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  32.37 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  29.21 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  26.7 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  26.57 
 
 		 227 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  26.82 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  30.58 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  26.97 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  34.92 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  26.57 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  30.56 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  27.32 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  27.17 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.24 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  28.02 
 
 		 270 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  32.83 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.97 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  30.37 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.97 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.97 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  28.35 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  28 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.78 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  30.11 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  28.02 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  30.58 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  32.8 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  28.49 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  29.1 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  29.05 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3233  nitroreductase  28.91 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  27.06 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  31.03 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  30.69 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  30.35 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.64 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  26.29 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  32.49 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  26.29 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  28.78 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  25.12 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  26.86 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  27.72 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  29.17 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  26.86 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.42 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  24.87 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  29.56 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  28.57 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  30.39 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  24.14 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  27.55 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  24.04 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  28.04 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  29.85 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.95 
 
 		 170 aa  71.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  26.25 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.66 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  25.85 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  27.57 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  27.22 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.21 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  26.46 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  37.29 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  26.46 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  29.08 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  30.48 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.33 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  20.34 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.09 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.13 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  25.93 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  25.93 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  26.46 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  25.93 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  25.12 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  31.03 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  22.66 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  22.66 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  22.66 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  30.68 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  29.08 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  22.66 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  27.27 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  28.3 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  25.81 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>