More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3233 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3233  nitroreductase  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.61 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.36 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.58 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  25.12 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.91 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.1 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  24.29 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  23.81 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  23.14 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  24.62 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  30.38 
 
 		 179 aa  62  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  23.38 
 
 		 176 aa  62  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.51 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  24.12 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  24.88 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  23 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.38 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  23.68 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.11 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.25 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  22.79 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.62 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  35.35 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  37.66 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  25.94 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  28.85 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.09 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  25.54 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  25.23 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  24.4 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  34.04 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.55 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  27.4 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.27 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  24.27 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  28.21 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  27.27 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  39.73 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  35.11 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  24.77 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  24.5 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  24.88 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  39.73 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  28.21 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  39.73 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  39.73 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  39.73 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  39.73 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  39.73 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  31.48 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  21.36 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  26.21 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  28.43 
 
 		 169 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.03 
 
 		 172 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.93 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  27.03 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  21.23 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  35.16 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  33.33 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  22.45 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  43.1 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  39.73 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  32.5 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  33.8 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  30.56 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  23.88 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  29.53 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  39.73 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  39.44 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.97 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  31.48 
 
 		 174 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.44 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  44.64 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  36.99 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  24.56 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  31.13 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  25 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  25 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  30.85 
 
 		 176 aa  52  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  41.51 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  24.55 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  30.14 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  23.98 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  28.04 
 
 		 334 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  22.97 
 
 		 178 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.49 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  25.69 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  33.78 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  21.8 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  28.77 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  26.79 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.64 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  27.03 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  26.39 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.44 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.64 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  25 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  23.08 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.69 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>