More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2948 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  67.49 
 
 		 204 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  64.04 
 
 		 204 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  55.88 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  50.5 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  46.89 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  44.98 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  43.78 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  42.05 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  39.55 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  39.36 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  38.3 
 
 		 202 aa  131  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  38.83 
 
 		 200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  32.32 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  32.32 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  32.32 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  32.32 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  32.32 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  34.69 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  32.32 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  31.82 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  34.18 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  31.31 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  37.63 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  31.31 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  36.93 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  31.47 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  37.43 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  33.5 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  32.68 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  32.5 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  32.5 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  32.5 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  32.5 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  32.84 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  31.31 
 
 		 205 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  33.51 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  32.34 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  32.34 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  32.34 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  32.84 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  32.84 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  32.34 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  32.09 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  32.26 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  32.34 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  29.57 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  32.78 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  31.37 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  29.38 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  31.86 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  30.81 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  31.32 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  31.37 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  32.37 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  30.54 
 
 		 199 aa  88.2  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  49.45 
 
 		 395 aa  88.2  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  31.66 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  25.93 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  24 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  38.42 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  28.5 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  24.64 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  25.93 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  29.49 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  32.79 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  32.79 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  32.79 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  32.79 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  32.79 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  32.79 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  32.79 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  33.71 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  29.69 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  24.64 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  34.22 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  29.79 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  26.7 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  30.32 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  32.24 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  23.76 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  25.64 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  34.67 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  28.31 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  27.89 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  25.25 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  27.44 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  25 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  29.26 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  29.26 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  25 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.6 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  29.63 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  30.32 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  29.26 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  28.72 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  30.17 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  29.26 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  23.88 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>