More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2852 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  100 
 
 		 178 aa  360  6e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  65.24 
 
 		 172 aa  228  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  62.05 
 
 		 173 aa  214  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  60.37 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  54.88 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  55.49 
 
 		 167 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  51.52 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  46.99 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  47.77 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  49.12 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.56 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  33.92 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  39.52 
 
 		 174 aa  90.9  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  40.52 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  33.89 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.76 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  35.71 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.46 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  37.66 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  34.46 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  34.73 
 
 		 167 aa  84.3  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  35.76 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  31.85 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.08 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.14 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  33.33 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  33.33 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.24 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  31.25 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  32.42 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  28.14 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.33 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.65 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  32.77 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  40.88 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  32.17 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  30.56 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.89 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.03 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  36.14 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.83 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  36.76 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  34.25 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  34.16 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.94 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.17 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  33.15 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  31.74 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  33.99 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  33.99 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  31.34 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  32.24 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  34.46 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  31.19 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.76 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  33.99 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  30 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  29.94 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  41.61 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.99 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.09 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.25 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  29.94 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  34.09 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.99 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.66 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  32.89 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  32.9 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.16 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.24 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  32.43 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  34.2 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  27.43 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  28.22 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  30.41 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  31.07 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32.26 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  30 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.31 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  33.57 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.69 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  29.94 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.51 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  33.71 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.8 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  34.9 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  29 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.86 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  25.91 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  25.71 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  35.48 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  23.53 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.34 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  33.33 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.43 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.17 
 
 		 584 aa  64.7  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.17 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  35.22 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  33.12 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>