More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2047 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  57.73 
 
 
201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  33.5 
 
 
190 aa  92  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.13 
 
 
202 aa  88.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.46 
 
 
190 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  35.83 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  34.67 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  31.63 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  34.25 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  31.41 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.42 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  31.18 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.45 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  32.84 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.79 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.92 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.78 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.84 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.34 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  35.96 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  29.67 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  29.63 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.06 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.63 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  31.77 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  30.26 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  33.15 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.53 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.63 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  32.04 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  31.63 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  33.16 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  33.16 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.46 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  33.33 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  32.26 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  31.12 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  40.94 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30.05 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.56 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  26.04 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  35.17 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  35 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  34.2 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  31.12 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  31.12 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  29.51 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  35 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  31.12 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  31.94 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.68 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  35.37 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  30.61 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.57 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  30.61 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  30.61 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  30.61 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.23 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  30.61 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  31.02 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  35 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.51 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  32.12 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  29.59 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  31.69 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.18 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.11 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  28.19 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.18 
 
 
178 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  26 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  58.82 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.23 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.15 
 
 
163 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  33.1 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.7 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  29.88 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  25.74 
 
 
278 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  27.72 
 
 
186 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.59 
 
 
584 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  32.39 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.33 
 
 
169 aa  61.6  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  29.73 
 
 
215 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  30.99 
 
 
173 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  32.37 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  30 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.26 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  23.23 
 
 
166 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  30.98 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.54 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  28.64 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  31.97 
 
 
171 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  31.97 
 
 
171 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.11 
 
 
275 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.9 
 
 
171 aa  59.3  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  26.67 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.17 
 
 
169 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.84 
 
 
253 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  32.17 
 
 
169 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.27 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>