More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2476 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  100 
 
 
195 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  74.87 
 
 
196 aa  295  4e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  55.38 
 
 
190 aa  221  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  49.48 
 
 
190 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  37.1 
 
 
194 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.32 
 
 
165 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  36.41 
 
 
178 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  35.87 
 
 
194 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  35.53 
 
 
215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  34.76 
 
 
215 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  34.76 
 
 
215 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  34.76 
 
 
215 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  34.76 
 
 
215 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  34.76 
 
 
215 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.33 
 
 
176 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  34.76 
 
 
215 aa  101  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  34.62 
 
 
215 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  34.76 
 
 
215 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  36.96 
 
 
174 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  34.29 
 
 
215 aa  98.6  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.09 
 
 
167 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  31.66 
 
 
215 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.53 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  32.82 
 
 
171 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.32 
 
 
163 aa  91.7  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.75 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  34.05 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.65 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  34.04 
 
 
184 aa  89  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30.99 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  34.24 
 
 
170 aa  88.2  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.35 
 
 
167 aa  87.8  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.76 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  33.69 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  34.62 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  34.43 
 
 
166 aa  86.3  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.55 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  29.35 
 
 
212 aa  85.5  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.19 
 
 
170 aa  85.5  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30 
 
 
278 aa  85.1  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.57 
 
 
187 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  34.43 
 
 
166 aa  84.7  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  33.89 
 
 
169 aa  84.7  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.9 
 
 
177 aa  84.7  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  32.29 
 
 
191 aa  84.3  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  35 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.89 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  35 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  33.87 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  31.98 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.28 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  34.25 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  28.19 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  28.25 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.47 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.68 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  32 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  31.12 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  34.33 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.86 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.02 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  30.15 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  29.38 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  25.87 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  35.2 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28.89 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  28.98 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.46 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  30.27 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.18 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  31.28 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  34.33 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.2 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  31.43 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  30.17 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.64 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.56 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  27.07 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  32 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  31.47 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  29.65 
 
 
169 aa  72  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  26.34 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  34.76 
 
 
348 aa  72  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.69 
 
 
169 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.26 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.9 
 
 
176 aa  72  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  31.32 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  30.86 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  34.25 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  28.42 
 
 
350 aa  71.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  28.93 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.89 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.89 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.08 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  31.22 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  30.41 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  31.28 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  30.86 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  32.96 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  30.29 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>