More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2170 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  100 
 
 
204 aa  401  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  45.7 
 
 
191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  39.01 
 
 
186 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  38.38 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  38.38 
 
 
185 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  42.62 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  37.84 
 
 
185 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  37.84 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  34.81 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  37.57 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  36.42 
 
 
186 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  39.15 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  35.87 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  37.43 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  36.07 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  33.69 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  36.21 
 
 
219 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  38.73 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  38.83 
 
 
207 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  36.88 
 
 
186 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  39.78 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  37.93 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  31.32 
 
 
182 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  37.06 
 
 
209 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  38.25 
 
 
187 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  30.94 
 
 
182 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  34.29 
 
 
183 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  35.11 
 
 
221 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  32.6 
 
 
182 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  33.15 
 
 
235 aa  105  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  34.29 
 
 
183 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  34.29 
 
 
183 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  34.29 
 
 
183 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  34.29 
 
 
183 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  34.29 
 
 
183 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  34.29 
 
 
183 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  34.29 
 
 
183 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  34.29 
 
 
183 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  30.39 
 
 
182 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  30.39 
 
 
182 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  30.39 
 
 
182 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  29.28 
 
 
182 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  36.56 
 
 
207 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  30.94 
 
 
183 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  35.64 
 
 
190 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  35.68 
 
 
207 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  32.6 
 
 
182 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  35.68 
 
 
207 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  29.28 
 
 
182 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  29.28 
 
 
182 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  35.68 
 
 
207 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  35.68 
 
 
207 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  32.6 
 
 
182 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  35.68 
 
 
207 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  29.28 
 
 
182 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  35.68 
 
 
207 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  32.98 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  35.68 
 
 
207 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  30.77 
 
 
187 aa  99  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  32.07 
 
 
194 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  35 
 
 
183 aa  99  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  29.83 
 
 
182 aa  98.6  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  34.38 
 
 
183 aa  98.6  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  31.22 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  34.55 
 
 
185 aa  98.6  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  32.57 
 
 
183 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  32.57 
 
 
183 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  32.42 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  32.57 
 
 
183 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  32.57 
 
 
183 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  32.57 
 
 
183 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  29.83 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  31.61 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  35.8 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  31.03 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  32.94 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  31.03 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  33.53 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  31.03 
 
 
183 aa  95.5  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  31.03 
 
 
183 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  34.76 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  31.32 
 
 
187 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  33.53 
 
 
191 aa  94  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  31.28 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  28.8 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
198 aa  93.2  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.91 
 
 
190 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  28.89 
 
 
182 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  34.36 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  32.22 
 
 
191 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  31.74 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  35.8 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  32.63 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  34.57 
 
 
169 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  34.16 
 
 
350 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  31.32 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  29.44 
 
 
182 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  37.29 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  28.14 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>